72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0142 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0142  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  100 
 
 		 157 aa  319  8e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.255389 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3435  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  54 
 
 		 157 aa  167  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4594  hypothetical protein  40.65 
 
 		 155 aa  117  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.623431 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1959  hypothetical protein  45.95 
 
 		 319 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1801  hypothetical protein  40.65 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.41183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4711  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  39.86 
 
 		 317 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89185  normal  0.0124058 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3634  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  39.86 
 
 		 317 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2064  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  42.97 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1798  hypothetical protein  41.45 
 
 		 329 aa  100  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.255644  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2723  hypothetical protein  39.74 
 
 		 152 aa  97.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2812  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40.79 
 
 		 154 aa  97.1  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427675  normal  0.0900203 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2297  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40 
 
 		 158 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.496603 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2819  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40.43 
 
 		 159 aa  95.5  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5295  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.91 
 
 		 159 aa  95.5  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.703739  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2214  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40.94 
 
 		 322 aa  87.8  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0864  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.81 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.993443 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1276  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.55 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5890  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.77 
 
 		 155 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2861  activator of Hsp90 ATPase-like protein  33.76 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1126  activator of Hsp90 ATPase-like protein  32.89 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.45 
 
 		 370 aa  65.1  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2856  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.48 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0332063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0005  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.45 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341386  hitchhiker  0.000491866 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1366  hypothetical protein  34.4 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1613  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.88 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.568107  normal  0.218883 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3783  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.83 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0529  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.86 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0553  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.86 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0557  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.86 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3125  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.45 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.313514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3360  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.87 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4030  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.95 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.06569  normal  0.373747 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5065  hypothetical protein  26.81 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0628651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2622  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.3 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3796  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.89 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.266434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3920  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.11 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170348  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2388  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.19 
 
 		 162 aa  51.2  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.312436  normal  0.420624 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4120  hypothetical protein  27.63 
 
 		 169 aa  50.8  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6720  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.85 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.902284  normal  0.793451 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1216  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.91 
 
 		 290 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  23.85 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.22195  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4132  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1975  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26 
 
 		 150 aa  47.4  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1448  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.82 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.977319  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4073  hypothetical protein  30.5 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1205  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.77 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5333  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.59 
 
 		 149 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0483  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.66 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.506287 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6290  hypothetical protein  26.47 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.807247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18320  hypothetical protein  30.3 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.360116 
 
 
-
 
NC_003296  RS04693  hypothetical protein  28.38 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.111587  normal  0.54865 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4897  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.25 
 
 		 164 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.486894  normal  0.32007 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5728  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.99 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3201  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.86 
 
 		 180 aa  44.7  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0692  hypothetical protein  28.57 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1819  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.13 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.154967 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4503  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  23.78 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.345264 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1108  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.21 
 
 		 149 aa  44.3  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0849  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.33 
 
 		 160 aa  43.9  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.442029  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2192  activator of Hsp90 ATPase-like protein  29.53 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2291  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.35 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.411397  hitchhiker  0.000261904 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1256  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  23.78 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4957  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.49 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0246277  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3632  hypothetical protein  27.27 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6172  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.18 
 
 		 186 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0106151  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0630  activator of Hsp90 ATPase-like protein  26.4 
 
 		 136 aa  42.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2068  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.52 
 
 		 136 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3940  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.77 
 
 		 192 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.494752  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5371  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  23.65 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1380  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.76 
 
 		 191 aa  41.6  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1109  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  23.78 
 
 		 152 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.692318 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4182  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.21 
 
 		 154 aa  40.8  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0911379 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>