76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS04693 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS04693  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  268  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.111587  normal  0.54865 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0483  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  59.7 
 
 
134 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.506287 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3920  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  60.15 
 
 
136 aa  167  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170348  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0612  hypothetical protein  57.81 
 
 
134 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2119  hypothetical protein  57.81 
 
 
134 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2205  hypothetical protein  57.81 
 
 
134 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719267  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1571  hypothetical protein  57.48 
 
 
243 aa  140  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2030  hypothetical protein  56.67 
 
 
96 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2989  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  43.85 
 
 
130 aa  101  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0808  hypothetical protein  51.55 
 
 
182 aa  99.4  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.674694  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4166  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40.15 
 
 
150 aa  94.4  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2301  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.64 
 
 
136 aa  93.6  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.647185 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4657  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40.6 
 
 
145 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3543  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40.16 
 
 
147 aa  92  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314773  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2068  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.85 
 
 
136 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3488  hypothetical protein  38.93 
 
 
136 aa  90.9  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.690871 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0630  activator of Hsp90 ATPase-like protein  35.88 
 
 
136 aa  89.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4503  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  39.29 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.345264 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3602  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.88 
 
 
143 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3926  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.88 
 
 
143 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51721  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4441  activator of Hsp90 ATPase-like  37.88 
 
 
143 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.788827  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4132  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.31 
 
 
143 aa  84.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3303  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.61 
 
 
143 aa  84  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2160  hypothetical protein  36.36 
 
 
143 aa  84  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2622  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.41 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3819  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.85 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.912588  normal  0.440605 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1384  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.6 
 
 
161 aa  70.1  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.495488 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3512  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.8 
 
 
154 aa  67.4  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2280  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.8 
 
 
154 aa  63.5  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1717  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.83 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000265045  decreased coverage  0.000058621 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4022  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.62 
 
 
149 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2023  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.11 
 
 
190 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107326  normal  0.0161346 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3146  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.3 
 
 
171 aa  55.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.225064  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.59 
 
 
240 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1469  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.83 
 
 
143 aa  53.9  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1474  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.34 
 
 
157 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2101  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.5 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.765061 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1234  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.5 
 
 
141 aa  50.8  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22380  hypothetical protein  33 
 
 
162 aa  50.4  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.14979  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2052  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.18 
 
 
145 aa  50.4  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.394992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3350  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.176478 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2390  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.1 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.733188  normal  0.497726 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1306  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.87 
 
 
189 aa  48.9  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4957  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.71 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0246277  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0940  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.28 
 
 
150 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6293  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.86 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8896  hypothetical protein  30.23 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0142  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.38 
 
 
157 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.255389 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1609  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.5 
 
 
178 aa  44.7  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3488  Polyketide cyclase/dehydrase  33.66 
 
 
153 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0171077 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3233  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.27 
 
 
178 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1866  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.01 
 
 
157 aa  43.9  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1920  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30 
 
 
260 aa  43.5  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0328503  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3374  hypothetical protein  26.97 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0607436  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4031  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.67 
 
 
213 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.282258  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1157  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.7 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1167  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.7 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.957262  normal  0.400526 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1140  activator of Hsp90 ATPase 1-like protein  27.7 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2321  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.5 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0352296 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1062  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.33 
 
 
333 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.429512  normal  0.982781 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2753  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.11 
 
 
175 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5333  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.38 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1064  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.59 
 
 
188 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1042  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.97 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293314  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0992  glutathione S-transferase-like transmembrane protein  31.03 
 
 
360 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644569  normal  0.256398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2166  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.52 
 
 
202 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108278  normal  0.0177452 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1819  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.25 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.154967 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2658  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.11 
 
 
175 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1211  hypothetical protein  38.78 
 
 
178 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.719023  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3982  hypothetical protein  26.92 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3408  hypothetical protein  31.76 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0250  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.2 
 
 
153 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3876  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.08 
 
 
149 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.688354  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0183  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.62 
 
 
177 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.924672  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2626  hypothetical protein  21.05 
 
 
159 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000655313  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2300  activator of Hsp90 ATPase-like protein  29.01 
 
 
269 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.868014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>