84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3876 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3876  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  100 
 
 		 149 aa  300  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.688354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2362  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  83.78 
 
 		 148 aa  262  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.129771 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2685  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  81.76 
 
 		 148 aa  253  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.117817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1540  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  45 
 
 		 161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241148  hitchhiker  0.00231818 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 437 aa  102  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8896  hypothetical protein  40.71 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0992  glutathione S-transferase-like transmembrane protein  31.54 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644569  normal  0.256398 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3201  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.94 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0250  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.57 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0823  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.48 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2501  glutathione S-transferase-like protein  29.01 
 
 		 360 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.919556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1056  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.85 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.566269 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1042  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.51 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293314  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0864  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.89 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.973222 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5333  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.43 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1819  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.3 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.154967 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0242  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.76 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152828 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1525  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.17 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1534  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.67 
 
 		 153 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0482501 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2847  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.69 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000365676  normal  0.0147483 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3360  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.7 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2192  activator of Hsp90 ATPase-like protein  27.56 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1366  hypothetical protein  27.86 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0940  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.78 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4182  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  24.44 
 
 		 154 aa  50.4  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0911379 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0893  hypothetical protein  27.21 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1866  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.41 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3233  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.41 
 
 		 178 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0707  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.69 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117656  hitchhiker  0.00673639 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3870  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.46 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.900009  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2425  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  24.83 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152043  normal  0.0111612 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1173  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.08 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.318638 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5728  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  24.5 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0853  hypothetical protein  27.21 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3408  hypothetical protein  25.74 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0835  hypothetical protein  29.69 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4073  hypothetical protein  28.26 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0476  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  unclonable  0.0000000161717  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3632  hypothetical protein  30.88 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3385  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.81 
 
 		 218 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0663  hypothetical protein  27.15 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2280  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.08 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3076  activator of Hsp90 ATPase-like protein  26.81 
 
 		 158 aa  44.3  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.454012  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0754  hypothetical protein  27.15 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2390  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.81 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.733188  normal  0.497726 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2427  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.74 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3634  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.06 
 
 		 317 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2210  activator of Hsp90 ATPase family protein  28.78 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4711  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.06 
 
 		 317 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89185  normal  0.0124058 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0188  hypothetical protein  28.38 
 
 		 158 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.248641 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3297  transcriptional regulator, ArsR family  28.69 
 
 		 268 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481478  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2248  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.17 
 
 		 294 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1335  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.4 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.298031 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5400  activator of Hsp90 ATPase-like protein  27.7 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4554  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.4 
 
 		 161 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1140  activator of Hsp90 ATPase 1-like protein  29.17 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2048  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.86 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.114132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1167  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.17 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.957262  normal  0.400526 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4061  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.08 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1157  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.17 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5461  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.7 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.816279  normal  0.0971764 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4808  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.28 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.380144  normal  0.85508 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4120  hypothetical protein  30.57 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2293  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.47 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.171783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22380  hypothetical protein  28.8 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.14979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1890  activator of Hsp90 ATPase family protein  29.25 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.358413 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2085  activator of Hsp90 ATPase family protein  29.5 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3813  hypothetical protein  31.25 
 
 		 163 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.691325  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3321  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.67 
 
 		 249 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3868  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.27 
 
 		 159 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0853747  normal  0.686212 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4558  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.28 
 
 		 156 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.801675 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2052  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.48 
 
 		 145 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.394992 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3168  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.82 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.737433  hitchhiker  0.000398428 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4957  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.46 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0246277  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5728  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.36 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668366  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6293  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.72 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04693  hypothetical protein  27.08 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.111587  normal  0.54865 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0694  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.97 
 
 		 159 aa  40.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280865 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3849  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.49 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2032  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.43 
 
 		 155 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100509  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3870  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.36 
 
 		 163 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102029  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3982  hypothetical protein  29.13 
 
 		 153 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5344  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.67 
 
 		 158 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4503  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.85 
 
 		 143 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.345264 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>