182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4711 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3634  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  100 
 
 
317 aa  654    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4711  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  100 
 
 
317 aa  654    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89185  normal  0.0124058 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1959  hypothetical protein  68.55 
 
 
319 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232061  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1798  hypothetical protein  59.49 
 
 
329 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.255644  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2214  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  57.28 
 
 
322 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3435  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  43.33 
 
 
157 aa  129  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119424  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2723  hypothetical protein  46.31 
 
 
152 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138119  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2064  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  45.45 
 
 
158 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2297  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  44.76 
 
 
158 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.496603 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5295  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  41.61 
 
 
159 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.703739  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0864  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  43.24 
 
 
157 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.993443 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2819  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40.54 
 
 
159 aa  110  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4594  hypothetical protein  40.62 
 
 
155 aa  109  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.623431 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2192  activator of Hsp90 ATPase-like protein  42.45 
 
 
157 aa  109  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1801  hypothetical protein  39.87 
 
 
154 aa  103  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.41183  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0142  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  39.86 
 
 
157 aa  102  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.255389 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1276  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38 
 
 
153 aa  97.1  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2812  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.24 
 
 
154 aa  95.9  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427675  normal  0.0900203 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3952  hypothetical protein  31.85 
 
 
165 aa  90.9  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.040762  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.9 
 
 
370 aa  90.5  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1613  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.67 
 
 
156 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.568107  normal  0.218883 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4558  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.92 
 
 
156 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.801675 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4182  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.46 
 
 
154 aa  87  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0911379 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2861  activator of Hsp90 ATPase-like protein  36.05 
 
 
158 aa  86.3  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1108  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.21 
 
 
149 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4445  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.51 
 
 
155 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4077  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.51 
 
 
155 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0406146  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1380  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  39.19 
 
 
191 aa  83.6  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0005  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.71 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341386  hitchhiker  0.000491866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5890  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.09 
 
 
155 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4120  hypothetical protein  35.17 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4030  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.89 
 
 
158 aa  77.8  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.06569  normal  0.373747 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5343  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.9 
 
 
161 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.621286  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4802  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.29 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1126  activator of Hsp90 ATPase-like protein  32.39 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0189  hypothetical protein  30.67 
 
 
161 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.398373 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0823  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.62 
 
 
161 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5401  activator of Hsp90 ATPase-like protein  30 
 
 
161 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5460  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30 
 
 
161 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4809  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30 
 
 
161 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.208056  normal  0.888607 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3849  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.29 
 
 
161 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0557  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.29 
 
 
159 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3783  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.87 
 
 
159 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0553  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.87 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0529  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.87 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3360  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.14 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2856  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.75 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0332063  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3125  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.45 
 
 
155 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.313514  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3201  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.14 
 
 
180 aa  68.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4061  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.45 
 
 
161 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3940  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.46 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.494752  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2291  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.36 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.411397  hitchhiker  0.000261904 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1335  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.82 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.298031 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1205  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.89 
 
 
165 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567309  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4554  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.82 
 
 
161 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3049  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.29 
 
 
167 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.324886 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2453  hypothetical protein  29.33 
 
 
157 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924775  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2388  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.56 
 
 
162 aa  63.5  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.312436  normal  0.420624 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5371  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.7 
 
 
161 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2413  hypothetical protein  26.17 
 
 
155 aa  62  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.436069  normal  0.522608 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3046  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.84 
 
 
169 aa  62  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.362039  normal  0.380423 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2682  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.21 
 
 
165 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0775646 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2885  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.19 
 
 
171 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0203353  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2271  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.74 
 
 
164 aa  60.8  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0374055  normal  0.0721688 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4102  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.87 
 
 
154 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4276  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.71 
 
 
164 aa  60.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2931  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.08 
 
 
165 aa  60.5  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000531059  hitchhiker  0.000870821 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18320  hypothetical protein  33.79 
 
 
145 aa  60.1  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.360116 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1366  hypothetical protein  30.63 
 
 
166 aa  60.1  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1819  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.51 
 
 
142 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.154967 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2147  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.31 
 
 
167 aa  59.7  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1131  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.72 
 
 
163 aa  59.3  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.805713  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2427  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.36 
 
 
147 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2212  hypothetical protein  28.87 
 
 
174 aa  58.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0650  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.41 
 
 
161 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0651  hypothetical protein  34.19 
 
 
149 aa  57.4  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6033  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.79 
 
 
167 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000241062  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3813  hypothetical protein  37.61 
 
 
163 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.691325  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4571  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.52 
 
 
322 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.811205  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3632  hypothetical protein  34.78 
 
 
146 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147242  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2148  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  23.27 
 
 
166 aa  57  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2725  hypothetical protein  34.18 
 
 
143 aa  56.6  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0307371  normal  0.0145206 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1215  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.85 
 
 
158 aa  56.6  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1116  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28 
 
 
434 aa  56.6  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0320317  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3870  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.61 
 
 
163 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102029  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4977  hypothetical protein  27.85 
 
 
173 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0491598  normal  0.619285 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0849  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.53 
 
 
160 aa  55.8  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.442029  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3957  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.7 
 
 
163 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3123  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.15 
 
 
162 aa  55.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603064  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3233  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.38 
 
 
162 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2806  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.43 
 
 
157 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2617  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.97 
 
 
167 aa  55.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.673337 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3870  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.57 
 
 
157 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.900009  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1072  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.06 
 
 
169 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2839  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.03 
 
 
169 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.171583 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0853  hypothetical protein  31.03 
 
 
147 aa  54.3  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4897  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.27 
 
 
164 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.486894  normal  0.32007 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1525  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.97 
 
 
142 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1189  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.43 
 
 
165 aa  53.5  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.437903 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2010  hypothetical protein  30.14 
 
 
152 aa  53.5  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.62 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>