33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3233 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_3233  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  100 
 
 
178 aa  361  3e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2557  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  44.51 
 
 
177 aa  152  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4050  activator of Hsp90 ATPase-like protein  46.47 
 
 
182 aa  152  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4111  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  41.76 
 
 
178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1306  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  41.48 
 
 
189 aa  128  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0681  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  41.62 
 
 
177 aa  124  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2670  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.57 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.158608  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2143  hypothetical protein  43.21 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3146  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.62 
 
 
171 aa  61.6  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.225064  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1001  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.89 
 
 
180 aa  59.7  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22380  hypothetical protein  33.15 
 
 
162 aa  60.1  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.14979  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3385  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.91 
 
 
218 aa  54.3  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1064  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.94 
 
 
188 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3876  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.41 
 
 
149 aa  48.9  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.688354  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2362  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.97 
 
 
148 aa  48.5  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.129771 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1474  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.67 
 
 
157 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4877  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.04 
 
 
175 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3350  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.3 
 
 
141 aa  46.2  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.176478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1469  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.6 
 
 
143 aa  45.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4957  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.31 
 
 
156 aa  45.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0246277  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1211  hypothetical protein  29.86 
 
 
178 aa  44.7  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.719023  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4594  hypothetical protein  27.73 
 
 
155 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.623431 
 
 
-
 
NC_003296  RS04693  hypothetical protein  26.27 
 
 
134 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.111587  normal  0.54865 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1609  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  23.67 
 
 
178 aa  43.9  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4166  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.27 
 
 
150 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2753  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.86 
 
 
175 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2658  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.17 
 
 
175 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3465  hypothetical protein  28.47 
 
 
178 aa  42.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000273241  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3297  transcriptional regulator, ArsR family  28.47 
 
 
268 aa  41.6  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481478  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1056  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.89 
 
 
141 aa  41.2  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.566269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7114  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.67 
 
 
177 aa  41.6  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.068816  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3201  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.39 
 
 
180 aa  41.2  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2685  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.21 
 
 
148 aa  40.8  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.117817  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>