60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3982 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3982  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  313  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1474  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  53.85 
 
 		 157 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04779  hypothetical protein  45.58 
 
 		 160 aa  134  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05658  hypothetical protein  45.58 
 
 		 160 aa  134  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3794  hypothetical protein  47.3 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3297  transcriptional regulator, ArsR family  47.18 
 
 		 268 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481478  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1019  transcriptional regulator, ArsR family  41.61 
 
 		 250 aa  110  9e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736024 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2390  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  43.07 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.733188  normal  0.497726 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1683  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40.43 
 
 		 152 aa  104  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.327006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0572  ArsR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 257 aa  99  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4686  regulatory protein, ArsR  42.57 
 
 		 263 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0399394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6786  hypothetical protein  37.89 
 
 		 182 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567712  normal  0.0558411 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0702  hypothetical protein  39.46 
 
 		 158 aa  94  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.900937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5112  transcriptional regulator, ArsR family  38.41 
 
 		 263 aa  92.8  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2031  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.66 
 
 		 268 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.298531 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0358  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.59 
 
 		 288 aa  87.4  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3089  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.48 
 
 		 161 aa  87.4  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.143848  normal  0.342191 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2722  ArsR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 250 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.430326 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2736  ArsR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 250 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.341929  normal  0.257848 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2692  ArsR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 250 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0598068  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1799  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.54 
 
 		 270 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1920  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.33 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0328503  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1101  ArsR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 247 aa  71.6  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000298233  normal  0.0138971 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0777  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0746  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.33 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448895  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1084  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.9 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.523644 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3783  hypothetical protein  29.71 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3920  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.33 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170348  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1783  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.07 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0979418  normal  0.0116667 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2766  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.24 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1144  hypothetical protein  29.2 
 
 		 197 aa  52.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000746366  normal  0.050753 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1609  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.6 
 
 		 178 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02030  hypothetical protein  35.64 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2554  hypothetical protein  26.32 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.142784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8896  hypothetical protein  33.64 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2989  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.39 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0523  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  24.62 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4132  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.27 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0674  hypothetical protein  56.1 
 
 		 53 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1115  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.15 
 
 		 148 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0906319 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0223  hypothetical protein  56.1 
 
 		 53 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0483  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.17 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.506287 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2052  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.394992 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0707  hypothetical protein  56.1 
 
 		 53 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.933221  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3868  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.28 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0853747  normal  0.686212 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1540  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.75 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241148  hitchhiker  0.00231818 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2622  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.13 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0360  hypothetical protein  29.77 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4022  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.12 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1109  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  24.62 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.692318 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1042  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.27 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293314  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0240  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.11 
 
 		 147 aa  43.9  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0626  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.94 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1256  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  23.85 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3360  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.89 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1119  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.26 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47591 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4050  activator of Hsp90 ATPase-like protein  27.66 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04693  hypothetical protein  26.92 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.111587  normal  0.54865 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1866  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.63 
 
 		 157 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3662  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.63 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>