22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_02030 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_02030  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  217  3.9999999999999997e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3297  transcriptional regulator, ArsR family  49.11 
 
 
268 aa  88.6  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481478  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1683  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.89 
 
 
152 aa  73.6  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.327006  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3794  hypothetical protein  35.71 
 
 
154 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1474  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.63 
 
 
157 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2390  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.78 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.733188  normal  0.497726 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3982  hypothetical protein  35.64 
 
 
153 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0358  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.45 
 
 
288 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05658  hypothetical protein  33.01 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04779  hypothetical protein  33.01 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2722  ArsR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
250 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.430326 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2736  ArsR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
250 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.341929  normal  0.257848 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2692  ArsR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
250 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0598068  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2031  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.45 
 
 
268 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.298531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5112  transcriptional regulator, ArsR family  32.11 
 
 
263 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4686  regulatory protein, ArsR  31.4 
 
 
263 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0399394  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2685  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.77 
 
 
148 aa  43.5  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.117817  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4050  activator of Hsp90 ATPase-like protein  27.97 
 
 
182 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1469  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.13 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0561  hypothetical protein  32 
 
 
151 aa  41.2  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3957  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.14 
 
 
163 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3408  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  40  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>