50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS04779 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05658  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  331  3e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04779  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  331  3e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3982  hypothetical protein  45.58 
 
 		 153 aa  134  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1474  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  43.4 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1019  transcriptional regulator, ArsR family  42.22 
 
 		 250 aa  108  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736024 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3297  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 		 268 aa  106  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481478  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6786  hypothetical protein  40 
 
 		 182 aa  104  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567712  normal  0.0558411 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3794  hypothetical protein  41.96 
 
 		 154 aa  101  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5112  transcriptional regulator, ArsR family  38.52 
 
 		 263 aa  95.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1683  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  39.42 
 
 		 152 aa  93.6  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.327006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2390  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.5 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.733188  normal  0.497726 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1920  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40.28 
 
 		 260 aa  89.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0328503  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1799  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.51 
 
 		 270 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4686  regulatory protein, ArsR  37.58 
 
 		 263 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0399394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3089  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.22 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.143848  normal  0.342191 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0777  transcriptional regulator, ArsR family  34.87 
 
 		 267 aa  85.5  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2031  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.12 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.298531 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0702  hypothetical protein  35.37 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.900937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0572  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2722  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 250 aa  81.3  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.430326 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2736  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 250 aa  81.3  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.341929  normal  0.257848 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2692  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 250 aa  81.3  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0598068  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0358  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.77 
 
 		 288 aa  78.2  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0746  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.82 
 
 		 151 aa  63.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448895  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1101  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000298233  normal  0.0138971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1469  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.46 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1084  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.15 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.523644 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02030  hypothetical protein  33.01 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1609  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.19 
 
 		 178 aa  47.8  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2052  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.57 
 
 		 145 aa  47.8  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.394992 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1534  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.56 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0482501 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3360  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.08 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6001  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  24.09 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2847  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.83 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000365676  normal  0.0147483 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3465  hypothetical protein  26.14 
 
 		 178 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000273241  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4050  activator of Hsp90 ATPase-like protein  26.47 
 
 		 182 aa  45.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1540  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.31 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241148  hitchhiker  0.00231818 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0242  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.56 
 
 		 153 aa  45.1  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2766  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3783  hypothetical protein  30.22 
 
 		 153 aa  44.7  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3350  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  24.22 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.176478 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1144  hypothetical protein  26.43 
 
 		 197 aa  43.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000746366  normal  0.050753 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1042  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.59 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293314  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8896  hypothetical protein  26.83 
 
 		 143 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1064  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.89 
 
 		 188 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0523  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.15 
 
 		 143 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4031  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.91 
 
 		 213 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.282258  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3385  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.89 
 
 		 218 aa  41.2  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3920  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.48 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170348  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1783  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.77 
 
 		 144 aa  40.8  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0979418  normal  0.0116667 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>