20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6001 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6001  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  100 
 
 
147 aa  303  7e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1109  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.08 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.692318 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1256  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.32 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2010  hypothetical protein  31.85 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.62 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3360  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.03 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1019  transcriptional regulator, ArsR family  26.53 
 
 
250 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736024 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1056  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.9 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.566269 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1042  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.12 
 
 
145 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293314  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_003296  RS04779  hypothetical protein  24.09 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05658  hypothetical protein  24.09 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0360  hypothetical protein  26.47 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5333  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.77 
 
 
149 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4061  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.28 
 
 
161 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1335  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.28 
 
 
161 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.298031 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1819  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.77 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.154967 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18320  hypothetical protein  25.37 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.360116 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12948  hypothetical protein  25 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0276307  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0694  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.71 
 
 
159 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0280865 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4554  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.58 
 
 
161 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1683  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  24.63 
 
 
152 aa  40.4  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.327006  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>