36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0702 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0702  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  316  6e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.900937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6786  hypothetical protein  44.97 
 
 		 182 aa  134  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567712  normal  0.0558411 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1019  transcriptional regulator, ArsR family  39.86 
 
 		 250 aa  95.1  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736024 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3982  hypothetical protein  39.46 
 
 		 153 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5112  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 263 aa  84.3  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_003296  RS04779  hypothetical protein  35.37 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05658  hypothetical protein  35.37 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1474  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.62 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2390  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.41 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.733188  normal  0.497726 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0358  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.1 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0572  ArsR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 257 aa  72  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3297  transcriptional regulator, ArsR family  39.16 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481478  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3794  hypothetical protein  36.49 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1683  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.37 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.327006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3089  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.67 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.143848  normal  0.342191 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1920  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.2 
 
 		 260 aa  64.3  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0328503  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2031  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.48 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.298531 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1799  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.68 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4686  regulatory protein, ArsR  31.29 
 
 		 263 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0399394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2722  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 250 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.430326 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2736  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 250 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.341929  normal  0.257848 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2692  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 250 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0598068  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0746  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.77 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448895  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0777  transcriptional regulator, ArsR family  31.08 
 
 		 267 aa  47.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.53 
 
 		 240 aa  47.4  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1101  ArsR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 247 aa  47  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000298233  normal  0.0138971 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1609  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.71 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3783  hypothetical protein  28.29 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1819  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.08 
 
 		 142 aa  44.3  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.154967 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2554  hypothetical protein  31.16 
 
 		 146 aa  44.3  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.142784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0523  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.68 
 
 		 143 aa  44.3  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2301  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.3 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.647185 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1783  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.79 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0979418  normal  0.0116667 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2766  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.79 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3360  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4657  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.13 
 
 		 145 aa  41.2  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>