More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2501 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_2501  glutathione S-transferase-like protein  100 
 
 
360 aa  745    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.919556  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0992  glutathione S-transferase-like transmembrane protein  77.44 
 
 
360 aa  588  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644569  normal  0.256398 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2340  glutathione S-transferase  80.99 
 
 
272 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0809017  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7338  glutathione S-transferase-like protein  33.49 
 
 
213 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.475649  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5333  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40.58 
 
 
149 aa  103  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51860  Glutathione S-transferase, N-terminal:Glutathione S-transferase, C-terminal  31.84 
 
 
259 aa  94.7  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0823  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.06 
 
 
161 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4182  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.46 
 
 
154 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0911379 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1366  hypothetical protein  38.52 
 
 
166 aa  89  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2192  activator of Hsp90 ATPase-like protein  32.86 
 
 
157 aa  89.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0170  putative glutathione S-transferase  27.59 
 
 
215 aa  88.2  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5247  putative glutathione S-transferase GSTF2 (GST-II)  29.95 
 
 
219 aa  85.9  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal  0.155796 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3201  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.88 
 
 
180 aa  85.5  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1167  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.72 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.957262  normal  0.400526 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1157  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.72 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1140  activator of Hsp90 ATPase 1-like protein  34.72 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1819  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.58 
 
 
142 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.154967 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1159  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.33 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0319  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.5 
 
 
206 aa  79.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.81 
 
 
220 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1042  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.35 
 
 
145 aa  78.2  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293314  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2010  hypothetical protein  31.76 
 
 
152 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.62 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  31.13 
 
 
220 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2291  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.1 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.411397  hitchhiker  0.000261904 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0940  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.05 
 
 
150 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3634  glutathione S-transferase domain protein  33.33 
 
 
219 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2330  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.05 
 
 
210 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.639612  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0694  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.82 
 
 
159 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0280865 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3360  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.37 
 
 
156 aa  73.9  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0254  stringent starvation protein A  27.12 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0916387  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1939  stringent starvation protein A  27.12 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191065  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4668  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.05 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4073  hypothetical protein  31.69 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2474  Glutathione S-transferase domain protein  32.73 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1256  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.39 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0703772  normal  0.143196 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1522  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.47 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000359291 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0033  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.02 
 
 
216 aa  72.8  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3580  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.92 
 
 
198 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0483717 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0707  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.25 
 
 
146 aa  71.2  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117656  hitchhiker  0.00673639 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0022  glutathione S-transferase-like protein  30.43 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428941  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3076  activator of Hsp90 ATPase-like protein  28.57 
 
 
158 aa  70.9  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.454012  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1525  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.09 
 
 
142 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0286  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.18 
 
 
153 aa  70.9  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3623  putative glutathione S-transferase protein  26.79 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0893077  normal  0.362102 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3671  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.21 
 
 
150 aa  70.5  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0834588 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.57 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.638139  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3168  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.25 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.737433  hitchhiker  0.000398428 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3375  Glutathione S-transferase domain protein  26.57 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0651  hypothetical protein  34.23 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1609  glutathione S-transferase-like protein  28.5 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.952522  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1056  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.21 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.566269 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8292  Glutathione S-transferase domain protein  29.02 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1043  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.41 
 
 
212 aa  68.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562576  normal  0.573525 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2757  hypothetical protein  25.4 
 
 
206 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  28.91 
 
 
220 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4050  glutathione S-transferase-like  26.92 
 
 
204 aa  68.9  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.767967  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.72 
 
 
207 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0893  hypothetical protein  29.58 
 
 
147 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2922  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.33 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.894063  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0853  hypothetical protein  29.58 
 
 
147 aa  67.4  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2427  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.17 
 
 
147 aa  67.8  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  26.83 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0847  glutathione S-transferase family protein  24.76 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.33451  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6021  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.46 
 
 
149 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1688  Glutathione S-transferase domain protein  25.84 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.423888 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3664  stringent starvation protein A  24.57 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2685  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.34 
 
 
148 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.117817  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2630  hypothetical protein  24.87 
 
 
206 aa  67  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2242  glutathione S-transferase-like protein  26.67 
 
 
202 aa  67  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.025244  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0851  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.1 
 
 
206 aa  67  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.451549 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6293  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.88 
 
 
143 aa  67  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5166  Glutathione S-transferase domain protein  26.09 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1512  Glutathione S-transferase domain  29.44 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.553363 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1487  glutathione S-transferase  27.57 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3556  Glutathione S-transferase domain protein  26.6 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0800  N-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate reductase  28 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3533  stringent starvation protein A  26.42 
 
 
209 aa  65.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0362173  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2289  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.54 
 
 
252 aa  65.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497964  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2467  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.33 
 
 
209 aa  65.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122974  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  31.14 
 
 
217 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2543  hypothetical protein  30.28 
 
 
148 aa  65.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.689147  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  29.17 
 
 
213 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4661  glutathione S-transferase-like  24.76 
 
 
204 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.39586  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3632  hypothetical protein  31.91 
 
 
146 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147242  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0754  stringent starvation protein A  24.57 
 
 
212 aa  65.5  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00653635  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  30.54 
 
 
214 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3332  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.69 
 
 
210 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  30.54 
 
 
214 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  30.54 
 
 
214 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2890  glutathione S-transferase-like  24.27 
 
 
215 aa  65.1  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0995  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.04 
 
 
213 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3324  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.91 
 
 
219 aa  64.7  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.495598  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0477  Glutathione S-transferase domain protein  24.59 
 
 
212 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149407  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3712  stringent starvation protein A  24.59 
 
 
212 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104882  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3547  stringent starvation protein A  24.59 
 
 
212 aa  64.3  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000170112  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3702  stringent starvation protein A  24.04 
 
 
212 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5460  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.21 
 
 
161 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4546  stringent starvation protein A  24.59 
 
 
212 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000354095  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0561  hypothetical protein  29.08 
 
 
151 aa  64.3  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3535  stringent starvation protein A  24.04 
 
 
212 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00187434  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>