150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5728 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012792  Vapar_5728  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  100 
 
 
149 aa  310  4.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4801  hypothetical protein  89.73 
 
 
148 aa  282  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7185  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  67.59 
 
 
148 aa  217  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2280  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  64.86 
 
 
150 aa  216  6e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483226  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0317  hypothetical protein  66.67 
 
 
148 aa  214  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2543  hypothetical protein  66.9 
 
 
148 aa  211  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.689147  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3717  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  64.83 
 
 
148 aa  210  7e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.147564 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0692  hypothetical protein  63.7 
 
 
148 aa  209  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3535  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  65.52 
 
 
147 aa  209  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.305725  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0651  hypothetical protein  64.58 
 
 
149 aa  206  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1608  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  63.95 
 
 
148 aa  204  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0853  hypothetical protein  64.34 
 
 
147 aa  203  7e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2266  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  63.95 
 
 
156 aa  202  9e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.173847  normal  0.851658 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2427  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  61.54 
 
 
147 aa  199  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2291  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  64.19 
 
 
154 aa  198  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.411397  hitchhiker  0.000261904 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5150  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  61.54 
 
 
147 aa  197  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4073  hypothetical protein  63.38 
 
 
147 aa  195  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2631  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  61.54 
 
 
147 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2293  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  59.44 
 
 
147 aa  192  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.171783  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1522  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  58.78 
 
 
151 aa  187  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000359291 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6021  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  57.53 
 
 
149 aa  186  9e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2210  activator of Hsp90 ATPase family protein  57.04 
 
 
149 aa  183  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1256  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  57.53 
 
 
149 aa  184  5e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0703772  normal  0.143196 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0893  hypothetical protein  58.04 
 
 
147 aa  181  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1890  activator of Hsp90 ATPase family protein  57.75 
 
 
149 aa  181  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.358413 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2085  activator of Hsp90 ATPase family protein  57.04 
 
 
149 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3671  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  51.7 
 
 
150 aa  167  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0834588 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3632  hypothetical protein  47.06 
 
 
146 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147242  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5344  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  39.07 
 
 
158 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4803  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.75 
 
 
158 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3321  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.6 
 
 
249 aa  100  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0188  hypothetical protein  38.41 
 
 
158 aa  100  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.248641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5400  activator of Hsp90 ATPase-like protein  38.41 
 
 
158 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5461  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.41 
 
 
158 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.816279  normal  0.0971764 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4808  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.75 
 
 
158 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.380144  normal  0.85508 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1917  hypothetical protein  35.97 
 
 
160 aa  98.6  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5435  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.25 
 
 
152 aa  93.6  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.740658 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3870  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.06 
 
 
157 aa  90.9  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.900009  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1831  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.71 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.948709  hitchhiker  0.00916424 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1654  hypothetical protein  32.64 
 
 
160 aa  84.3  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.403228  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4095  hypothetical protein  31.58 
 
 
286 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4171  hypothetical protein  31.58 
 
 
286 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4326  hypothetical protein  31.58 
 
 
286 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0121723  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2288  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.46 
 
 
163 aa  82  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0245007  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2028  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.47 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0754  hypothetical protein  35.21 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0663  hypothetical protein  34.51 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1458  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.520072  normal  0.193844 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1326  activator of Hsp90 ATPase-like protein  36.04 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5623  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.45 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0992  glutathione S-transferase-like transmembrane protein  30.61 
 
 
360 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644569  normal  0.256398 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4451  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.21 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1406  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.91 
 
 
207 aa  63.9  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2501  glutathione S-transferase-like protein  30.34 
 
 
360 aa  63.5  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.919556  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1121  hypothetical protein  28.39 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0695467  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0823  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.79 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2425  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.34 
 
 
164 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152043  normal  0.0111612 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4897  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.54 
 
 
164 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.486894  normal  0.32007 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1116  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.61 
 
 
434 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0320317  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1366  hypothetical protein  29.5 
 
 
166 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1975  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.18 
 
 
150 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2212  hypothetical protein  37.76 
 
 
174 aa  54.3  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1719  hypothetical protein  28.48 
 
 
161 aa  53.9  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2271  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.17 
 
 
164 aa  53.9  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0374055  normal  0.0721688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1380  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.73 
 
 
191 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4021  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.51 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2032  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.58 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100509  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2115  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.04 
 
 
168 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.312294  decreased coverage  0.0026302 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0553  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.87 
 
 
159 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2048  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.17 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.114132  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4182  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.57 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0911379 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0529  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.87 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3783  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.43 
 
 
159 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2839  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.53 
 
 
169 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.171583 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1525  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.9 
 
 
142 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0557  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.87 
 
 
159 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2192  activator of Hsp90 ATPase-like protein  26.28 
 
 
157 aa  50.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2108  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.62 
 
 
158 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00881054  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1855  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.91 
 
 
176 aa  50.4  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1819  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.53 
 
 
142 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.154967 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3957  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.67 
 
 
163 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1056  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.566269 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3813  hypothetical protein  31.68 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.691325  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4802  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.58 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3870  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.68 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8896  hypothetical protein  29.25 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2622  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.66 
 
 
155 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5343  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.58 
 
 
161 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.621286  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0476  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.12 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  unclonable  0.0000000161717  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3360  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  23.74 
 
 
156 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4276  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.49 
 
 
164 aa  47  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0189  hypothetical protein  36.84 
 
 
161 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.398373 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5401  activator of Hsp90 ATPase-like protein  32.53 
 
 
161 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5413  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.08 
 
 
156 aa  47  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0639907 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0940  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.9 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5460  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.53 
 
 
161 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3634  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.45 
 
 
317 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1072  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.25 
 
 
169 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4809  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.53 
 
 
161 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.208056  normal  0.888607 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5333  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.37 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>