56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3512 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_3512  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  100 
 
 
154 aa  319  7e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2280  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  39.74 
 
 
154 aa  112  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4503  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.93 
 
 
143 aa  100  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.345264 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2622  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.58 
 
 
155 aa  97.4  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1384  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.8 
 
 
161 aa  97.1  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.495488 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4132  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.66 
 
 
143 aa  96.7  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2160  hypothetical protein  36.24 
 
 
143 aa  92.8  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4166  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.36 
 
 
150 aa  90.5  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2101  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.57 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.765061 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4441  activator of Hsp90 ATPase-like  34.9 
 
 
143 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.788827  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3602  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.9 
 
 
143 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3926  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.9 
 
 
143 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51721  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4657  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.78 
 
 
145 aa  89  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3303  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.77 
 
 
143 aa  85.5  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3543  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.41 
 
 
147 aa  85.1  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314773  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1717  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.58 
 
 
146 aa  84.3  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000265045  decreased coverage  0.000058621 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2301  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.04 
 
 
136 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.647185 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3819  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.56 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.912588  normal  0.440605 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2068  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.89 
 
 
136 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3488  hypothetical protein  32.39 
 
 
136 aa  81.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.690871 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3920  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.03 
 
 
136 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170348  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0483  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.21 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.506287 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0630  activator of Hsp90 ATPase-like protein  32.03 
 
 
136 aa  71.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04693  hypothetical protein  33.8 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.111587  normal  0.54865 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4022  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.4 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3374  hypothetical protein  31.47 
 
 
142 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0607436  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1571  hypothetical protein  31.76 
 
 
243 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4957  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.85 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0246277  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2119  hypothetical protein  31.21 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0612  hypothetical protein  31.21 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2205  hypothetical protein  31.21 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719267  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1469  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.33 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1424  hypothetical protein  42.19 
 
 
74 aa  56.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0828186  normal  0.0938216 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0560  hypothetical protein  29.66 
 
 
153 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.343341  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25 
 
 
240 aa  55.1  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3350  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.47 
 
 
141 aa  55.1  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.176478 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2052  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.11 
 
 
145 aa  54.7  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.394992 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2604  hypothetical protein  31.06 
 
 
153 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  26.28 
 
 
437 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0901  hypothetical protein  30.53 
 
 
153 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2465  hypothetical protein  30.53 
 
 
153 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464565  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2030  hypothetical protein  32.69 
 
 
96 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1234  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.77 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2321  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.32 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0352296 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1115  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.01 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0906319 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1119  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.78 
 
 
148 aa  47.4  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47591 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2989  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.07 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1866  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.48 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6293  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.15 
 
 
143 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0626  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.22 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3892  hypothetical protein  26.43 
 
 
162 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.942271 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0992  glutathione S-transferase-like transmembrane protein  25.95 
 
 
360 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644569  normal  0.256398 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3297  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 
268 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481478  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0250  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.38 
 
 
153 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2550  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.35 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.367677  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1975  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.56 
 
 
150 aa  41.2  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>