30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1801 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1801  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  310  2.9999999999999996e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.41183  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3435  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  45.75 
 
 
157 aa  130  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119424  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0142  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40.65 
 
 
157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.255389 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1959  hypothetical protein  44 
 
 
319 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232061  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3634  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  39.87 
 
 
317 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4711  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  39.87 
 
 
317 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89185  normal  0.0124058 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2214  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.31 
 
 
322 aa  90.1  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2812  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.19 
 
 
154 aa  85.1  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427675  normal  0.0900203 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4594  hypothetical protein  32.48 
 
 
155 aa  84  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.623431 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1798  hypothetical protein  36.49 
 
 
329 aa  84  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.255644  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2723  hypothetical protein  34.42 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138119  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2064  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.56 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0864  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.81 
 
 
157 aa  77.8  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.993443 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2297  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.1 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.496603 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1276  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.46 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2861  activator of Hsp90 ATPase-like protein  31.61 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5295  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  24.68 
 
 
159 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.703739  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5890  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.58 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2819  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.97 
 
 
159 aa  57.4  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2192  activator of Hsp90 ATPase-like protein  31.51 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.85 
 
 
370 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1613  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.15 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.568107  normal  0.218883 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1126  activator of Hsp90 ATPase-like protein  25 
 
 
160 aa  48.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1906  hypothetical protein  30.08 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1975  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.49 
 
 
150 aa  44.3  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0005  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.92 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341386  hitchhiker  0.000491866 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4120  hypothetical protein  31.78 
 
 
169 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1366  hypothetical protein  27.46 
 
 
166 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2212  hypothetical protein  27.68 
 
 
174 aa  40.8  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1189  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.35 
 
 
165 aa  40.4  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.437903 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>