40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1913 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1913  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  347  6e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2393  hypothetical protein  72.02 
 
 
168 aa  259  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2350  hypothetical protein  72.02 
 
 
168 aa  259  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5333  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.83 
 
 
149 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2839  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.91 
 
 
169 aa  54.3  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.171583 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1366  hypothetical protein  29.84 
 
 
166 aa  54.3  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1042  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  23.97 
 
 
145 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293314  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2192  activator of Hsp90 ATPase-like protein  30.95 
 
 
157 aa  53.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1072  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.96 
 
 
169 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4897  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.46 
 
 
164 aa  51.6  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.486894  normal  0.32007 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3360  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25 
 
 
156 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0992  glutathione S-transferase-like transmembrane protein  26.23 
 
 
360 aa  49.3  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644569  normal  0.256398 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3717  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.71 
 
 
148 aa  48.9  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.147564 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0557  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.18 
 
 
159 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0553  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.18 
 
 
159 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4558  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  24.2 
 
 
156 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.801675 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0529  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.18 
 
 
159 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3783  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.18 
 
 
159 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2543  hypothetical protein  32.58 
 
 
148 aa  47  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.689147  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4182  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  23.9 
 
 
154 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0911379 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2212  hypothetical protein  31.71 
 
 
174 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4445  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  24.05 
 
 
155 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4077  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  24.05 
 
 
155 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0406146  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0692  hypothetical protein  32.91 
 
 
148 aa  45.1  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22230  hypothetical protein  35.37 
 
 
208 aa  44.7  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.220575  normal  0.101332 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1126  activator of Hsp90 ATPase-like protein  31.65 
 
 
160 aa  44.7  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0694  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  19.46 
 
 
159 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0280865 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0286  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  23.13 
 
 
153 aa  44.3  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1819  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  22.03 
 
 
142 aa  44.3  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.154967 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2280  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.47 
 
 
150 aa  43.9  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483226  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1608  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.11 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0651  hypothetical protein  29.11 
 
 
149 aa  43.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1522  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.86 
 
 
151 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000359291 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0005  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.71 
 
 
160 aa  42.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341386  hitchhiker  0.000491866 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2291  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.38 
 
 
154 aa  42.4  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.411397  hitchhiker  0.000261904 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2501  glutathione S-transferase-like protein  24.22 
 
 
360 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.919556  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2266  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.11 
 
 
156 aa  42  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.173847  normal  0.851658 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4030  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  22.22 
 
 
158 aa  41.6  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.06569  normal  0.373747 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4594  hypothetical protein  30.25 
 
 
155 aa  41.6  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.623431 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2427  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.5 
 
 
147 aa  40.8  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>