145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2224 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2224  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
213 aa  434  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  87.32 
 
 
213 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  67.61 
 
 
213 aa  309  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  64.02 
 
 
220 aa  296  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  64.02 
 
 
220 aa  296  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  61.5 
 
 
215 aa  286  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  60.27 
 
 
219 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  59.09 
 
 
220 aa  280  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  57.28 
 
 
215 aa  278  6e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  59.17 
 
 
221 aa  276  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  58.41 
 
 
220 aa  276  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  56.34 
 
 
215 aa  275  4e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6866  deaminase-reductase domain-containing protein  66.2 
 
 
210 aa  275  4e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  58.69 
 
 
215 aa  275  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  62.15 
 
 
214 aa  271  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2571  deaminase-reductase domain-containing protein  63.43 
 
 
217 aa  266  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6197  bifunctional deaminase-reductase domain protein  60.47 
 
 
218 aa  266  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  56.81 
 
 
214 aa  264  5.999999999999999e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0510  deaminase-reductase domain-containing protein  56.11 
 
 
227 aa  254  8e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.120308  normal  0.164935 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  47.89 
 
 
217 aa  218  6e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0378  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.44 
 
 
219 aa  206  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3505  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.91 
 
 
219 aa  202  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000551807  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  46.98 
 
 
223 aa  198  5e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.48 
 
 
201 aa  194  9e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1051  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.66 
 
 
218 aa  188  5e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0782289  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5625  putative deaminase-reductase  59.15 
 
 
190 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  50.75 
 
 
201 aa  184  7e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.39 
 
 
214 aa  179  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5453  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  43.46 
 
 
210 aa  178  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.32 
 
 
213 aa  171  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00121838  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2668  DNA-binding protein  43.92 
 
 
214 aa  160  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4493  bifunctional deaminase-reductase-like protein  44.26 
 
 
214 aa  158  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3337  DNA-binding protein  43.17 
 
 
216 aa  158  7e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3399  DNA-binding protein  43.17 
 
 
216 aa  158  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3348  DNA-binding protein  43.17 
 
 
216 aa  158  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1818  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.74 
 
 
211 aa  158  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450783  hitchhiker  0.00922336 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.4 
 
 
199 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1614  hypothetical protein  38.81 
 
 
216 aa  152  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.225791 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1260  DNA-binding protein  42.02 
 
 
215 aa  148  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.933847  normal  0.428318 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  38.53 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0434  bifunctional deaminase-reductase-like protein  40.98 
 
 
214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  37.38 
 
 
221 aa  138  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1876  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.72 
 
 
206 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  36.19 
 
 
222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.25 
 
 
206 aa  132  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6622  DNA-binding protein  51.82 
 
 
200 aa  131  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02020  dihydrofolate reductase  36.56 
 
 
230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.07 
 
 
206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.75 
 
 
240 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.73 
 
 
370 aa  122  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.4 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.65 
 
 
211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4462  deaminase-reductase domain-containing protein  32.86 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8364  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.89 
 
 
213 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.37 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.84 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.47 
 
 
199 aa  75.5  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  27.94 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  37.07 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3340  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.15 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  28.04 
 
 
193 aa  63.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  32.07 
 
 
193 aa  60.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.8 
 
 
182 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.82 
 
 
180 aa  60.5  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  30.89 
 
 
197 aa  59.7  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.84 
 
 
180 aa  58.5  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  29.83 
 
 
180 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  34.71 
 
 
193 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  31.16 
 
 
180 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.68 
 
 
184 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5268  hypothetical protein  28.3 
 
 
194 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  26.37 
 
 
215 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 
183 aa  55.1  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.83 
 
 
177 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30 
 
 
177 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  30 
 
 
177 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  26.32 
 
 
183 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7746  hypothetical protein  26.96 
 
 
194 aa  51.6  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 
179 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3583  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.42 
 
 
197 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255249  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.57 
 
 
173 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  36.51 
 
 
178 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3970  deaminase-reductase domain-containing protein  28.47 
 
 
186 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0431  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.57 
 
 
173 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2032  riboflavin biosynthesis protein RibD  30.56 
 
 
218 aa  48.9  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.995676  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.63 
 
 
181 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.29 
 
 
176 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  37.93 
 
 
199 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  27.2 
 
 
174 aa  48.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  28.57 
 
 
178 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.92 
 
 
175 aa  47.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  25.16 
 
 
215 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  40 
 
 
228 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.66 
 
 
181 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.33 
 
 
194 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.02 
 
 
183 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.68 
 
 
204 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.94 
 
 
186 aa  46.6  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14470  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 
183 aa  46.2  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.82 
 
 
221 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>