80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0434 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0434  bifunctional deaminase-reductase-like protein  100 
 
 		 214 aa  436  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1260  DNA-binding protein  77.93 
 
 		 215 aa  347  9e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.933847  normal  0.428318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3348  DNA-binding protein  77.34 
 
 		 216 aa  330  1e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3399  DNA-binding protein  77.34 
 
 		 216 aa  330  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3337  DNA-binding protein  77.34 
 
 		 216 aa  330  1e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2668  DNA-binding protein  71.56 
 
 		 214 aa  318  5e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4493  bifunctional deaminase-reductase-like protein  70.28 
 
 		 214 aa  314  8e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6622  DNA-binding protein  60 
 
 		 200 aa  229  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  54.98 
 
 		 217 aa  218  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0378  bifunctional deaminase-reductase domain protein  51.4 
 
 		 219 aa  212  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1051  bifunctional deaminase-reductase domain protein  52.86 
 
 		 218 aa  209  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0782289  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3505  bifunctional deaminase-reductase domain protein  51.63 
 
 		 219 aa  202  4e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000551807  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  51.17 
 
 		 223 aa  200  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1818  bifunctional deaminase-reductase domain protein  50.47 
 
 		 211 aa  185  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450783  hitchhiker  0.00922336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5453  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  49.05 
 
 		 210 aa  181  9.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  50.27 
 
 		 214 aa  178  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  46.45 
 
 		 215 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  50.55 
 
 		 215 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.19 
 
 		 213 aa  167  9e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00121838  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02020  dihydrofolate reductase  44.39 
 
 		 230 aa  165  5.9999999999999996e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.95 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  45.9 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.5 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  47.8 
 
 		 215 aa  154  7e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  45.45 
 
 		 221 aa  154  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  44.68 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.21 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.16 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.16 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  43.78 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6197  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.32 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.78 
 
 		 201 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0510  deaminase-reductase domain-containing protein  46.32 
 
 		 227 aa  138  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.120308  normal  0.164935 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.98 
 
 		 213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1614  hypothetical protein  41.44 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.225791 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2571  deaminase-reductase domain-containing protein  43.01 
 
 		 217 aa  131  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  41.94 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2224  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.98 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6866  deaminase-reductase domain-containing protein  40.11 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.86 
 
 		 214 aa  111  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.41 
 
 		 199 aa  104  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1876  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.04 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.2 
 
 		 370 aa  102  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.57 
 
 		 212 aa  99.8  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  41.79 
 
 		 222 aa  98.2  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5625  putative deaminase-reductase  38.99 
 
 		 190 aa  92  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.79 
 
 		 206 aa  91.7  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  39.1 
 
 		 221 aa  86.7  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  41.38 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.54 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.74 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.71 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.28 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.23 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8364  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.73 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4462  deaminase-reductase domain-containing protein  35.46 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  30 
 
 		 193 aa  52.8  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.72 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2640  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.12 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  30.65 
 
 		 180 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  26.22 
 
 		 187 aa  49.3  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  30.56 
 
 		 181 aa  48.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.09 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.65 
 
 		 184 aa  45.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  30.25 
 
 		 182 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  30.08 
 
 		 180 aa  45.1  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  36.23 
 
 		 180 aa  45.1  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.86 
 
 		 186 aa  45.1  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.15 
 
 		 173 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  26.32 
 
 		 176 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.56 
 
 		 180 aa  44.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.74 
 
 		 182 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  37.5 
 
 		 178 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5956  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  26.32 
 
 		 188 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25060  dihydrofolate reductase  29.87 
 
 		 193 aa  42.4  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.68 
 
 		 177 aa  42  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.23 
 
 		 187 aa  42  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3842  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.63 
 
 		 185 aa  42  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.13 
 
 		 183 aa  41.6  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.17 
 
 		 177 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>