123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0378 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0378  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
219 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3505  bifunctional deaminase-reductase domain protein  82.11 
 
 
219 aa  353  1e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000551807  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  75.46 
 
 
223 aa  335  2.9999999999999997e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  70.23 
 
 
217 aa  306  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1051  bifunctional deaminase-reductase domain protein  69.95 
 
 
218 aa  300  1e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0782289  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5453  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  60.19 
 
 
210 aa  263  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1818  bifunctional deaminase-reductase domain protein  57.8 
 
 
211 aa  250  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450783  hitchhiker  0.00922336 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  58.6 
 
 
213 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00121838  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4493  bifunctional deaminase-reductase-like protein  55.09 
 
 
214 aa  229  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  51.85 
 
 
215 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  50 
 
 
215 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2668  DNA-binding protein  52.09 
 
 
214 aa  218  5e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  52.05 
 
 
215 aa  216  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3337  DNA-binding protein  51.94 
 
 
216 aa  214  7e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3399  DNA-binding protein  51.94 
 
 
216 aa  214  7e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3348  DNA-binding protein  51.94 
 
 
216 aa  214  7e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1260  DNA-binding protein  50.46 
 
 
215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.933847  normal  0.428318 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.47 
 
 
220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0434  bifunctional deaminase-reductase-like protein  51.4 
 
 
214 aa  212  3.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  47.69 
 
 
215 aa  211  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.2 
 
 
220 aa  209  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.87 
 
 
219 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  48.18 
 
 
221 aa  207  9e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  46.98 
 
 
214 aa  202  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.37 
 
 
220 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.37 
 
 
220 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  46.98 
 
 
214 aa  201  8e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  52.36 
 
 
213 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.44 
 
 
213 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0510  deaminase-reductase domain-containing protein  48.87 
 
 
227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.120308  normal  0.164935 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02020  dihydrofolate reductase  48.58 
 
 
230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2224  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.44 
 
 
213 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6197  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.25 
 
 
218 aa  184  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2571  deaminase-reductase domain-containing protein  47.47 
 
 
217 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6622  DNA-binding protein  59.49 
 
 
200 aa  180  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6866  deaminase-reductase domain-containing protein  47.44 
 
 
210 aa  179  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.26 
 
 
201 aa  177  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1614  hypothetical protein  45.45 
 
 
216 aa  176  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.225791 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  44.55 
 
 
219 aa  166  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.55 
 
 
214 aa  154  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.32 
 
 
370 aa  137  8.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.36 
 
 
199 aa  131  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5625  putative deaminase-reductase  46.39 
 
 
190 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  41.71 
 
 
201 aa  126  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1876  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.29 
 
 
206 aa  122  6e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.56 
 
 
212 aa  109  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.93 
 
 
206 aa  106  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  34.23 
 
 
222 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.26 
 
 
206 aa  98.6  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.35 
 
 
240 aa  98.6  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  34.43 
 
 
221 aa  95.1  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.25 
 
 
211 aa  90.9  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8364  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.49 
 
 
213 aa  72  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.14 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4462  deaminase-reductase domain-containing protein  29.03 
 
 
202 aa  62.8  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.51 
 
 
206 aa  61.6  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  35.29 
 
 
228 aa  60.5  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  30.66 
 
 
187 aa  60.1  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7746  hypothetical protein  29.19 
 
 
194 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  27.84 
 
 
197 aa  58.5  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  25.71 
 
 
197 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  31.21 
 
 
180 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  28.85 
 
 
193 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09530  dihydrofolate reductase  27.96 
 
 
193 aa  55.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.170117  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.23 
 
 
182 aa  55.1  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  28.3 
 
 
193 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  31.15 
 
 
193 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.16 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  31.17 
 
 
173 aa  52.4  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.39 
 
 
188 aa  52.4  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  30.06 
 
 
199 aa  52  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.03 
 
 
184 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  40 
 
 
178 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.54 
 
 
180 aa  49.7  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  28.06 
 
 
183 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
175 aa  48.9  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.97 
 
 
204 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  32.05 
 
 
176 aa  48.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  30 
 
 
200 aa  47.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.57 
 
 
183 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.12 
 
 
204 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.47 
 
 
188 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4631  deaminase-reductase domain-containing protein  27.97 
 
 
192 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.47 
 
 
212 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  30.23 
 
 
181 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  27.12 
 
 
215 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  27.27 
 
 
180 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.45 
 
 
189 aa  46.2  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5564  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.84 
 
 
188 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.73 
 
 
180 aa  46.2  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3583  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.22 
 
 
197 aa  45.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255249  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.5 
 
 
196 aa  45.4  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.06 
 
 
180 aa  45.4  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2032  riboflavin biosynthesis protein RibD  29.57 
 
 
218 aa  45.4  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.995676  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3340  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.18 
 
 
185 aa  45.1  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.86 
 
 
173 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  30.59 
 
 
180 aa  44.3  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  34.17 
 
 
178 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  34.33 
 
 
181 aa  43.9  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.81 
 
 
188 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>