161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1101 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  100 
 
 		 187 aa  384  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.83 
 
 		 182 aa  153  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  35.23 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.48 
 
 		 199 aa  92.8  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.65 
 
 		 206 aa  92.8  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.86 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  31.1 
 
 		 221 aa  89.4  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  30.14 
 
 		 222 aa  88.6  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  32.26 
 
 		 180 aa  85.9  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.98 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.75 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  36.76 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.48 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.48 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.87 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.56 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  37.6 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.61 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.61 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.55 
 
 		 180 aa  77.8  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  32.18 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  31.87 
 
 		 180 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.22 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  36.8 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.36 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.77 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.96 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.43 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.26 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5268  hypothetical protein  31.32 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3340  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.59 
 
 		 185 aa  72  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  33.86 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2032  riboflavin biosynthesis protein RibD  34.86 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.995676  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.9 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4493  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.55 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  33.87 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  34.48 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  32.65 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.41 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  31.94 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.05 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1963  hypothetical protein  28.26 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3337  DNA-binding protein  28.57 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3399  DNA-binding protein  28.57 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3348  DNA-binding protein  28.57 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  32.3 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6866  deaminase-reductase domain-containing protein  29.95 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  32.02 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8364  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.61 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3583  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.05 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  35 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1614  hypothetical protein  30.77 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.225791 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  28.27 
 
 		 176 aa  62  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.98 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  30.28 
 
 		 219 aa  62  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1969  hypothetical protein  28.11 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1260  DNA-binding protein  30.3 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.933847  normal  0.428318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2571  deaminase-reductase domain-containing protein  39.84 
 
 		 217 aa  61.2  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  33.11 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  30 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7746  hypothetical protein  28.4 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  27.32 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0378  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.66 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.49 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  30.3 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  30.21 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  23.86 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  26.56 
 
 		 390 aa  58.5  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1876  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.98 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2224  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.07 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  30.73 
 
 		 197 aa  57.8  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  26.4 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  29.01 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1818  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.58 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450783  hitchhiker  0.00922336 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.71 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  31.01 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.61 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1051  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.08 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0782289  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2668  DNA-binding protein  27.45 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  30.32 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6197  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.59 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0510  deaminase-reductase domain-containing protein  33.61 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.120308  normal  0.164935 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  28.48 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.63 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  29.37 
 
 		 180 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.01 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.98 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6622  DNA-binding protein  31.72 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  27.04 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  23.66 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.12 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.97 
 
 		 178 aa  52.8  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5453  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  27.68 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.85 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.7 
 
 		 176 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  27.63 
 
 		 186 aa  52  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02020  dihydrofolate reductase  28.57 
 
 		 230 aa  51.6  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3505  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.47 
 
 		 219 aa  51.2  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000551807  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  29.93 
 
 		 180 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  24.07 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>