143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5058 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 		 215 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  68.37 
 
 		 215 aa  312  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  65.12 
 
 		 220 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  64.95 
 
 		 215 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  64.55 
 
 		 220 aa  299  2e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  63.85 
 
 		 215 aa  298  4e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  64.38 
 
 		 219 aa  296  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  63.38 
 
 		 214 aa  294  9e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  64.02 
 
 		 220 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  64.02 
 
 		 220 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  62.56 
 
 		 221 aa  288  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  64.95 
 
 		 214 aa  284  7e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  58.69 
 
 		 213 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0510  deaminase-reductase domain-containing protein  63.8 
 
 		 227 aa  279  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.120308  normal  0.164935 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  55.4 
 
 		 213 aa  270  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6197  bifunctional deaminase-reductase domain protein  60.47 
 
 		 218 aa  264  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2224  bifunctional deaminase-reductase domain protein  57.28 
 
 		 213 aa  259  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6866  deaminase-reductase domain-containing protein  55.4 
 
 		 210 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2571  deaminase-reductase domain-containing protein  56.02 
 
 		 217 aa  228  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  51.39 
 
 		 223 aa  215  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  47.89 
 
 		 217 aa  211  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0378  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.69 
 
 		 219 aa  211  5.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.84 
 
 		 201 aa  203  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1051  bifunctional deaminase-reductase domain protein  49.06 
 
 		 218 aa  202  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0782289  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3505  bifunctional deaminase-reductase domain protein  49.08 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000551807  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  50.7 
 
 		 214 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5453  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  43.46 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2668  DNA-binding protein  48.66 
 
 		 214 aa  175  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1818  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.33 
 
 		 211 aa  174  8e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450783  hitchhiker  0.00922336 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.19 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00121838  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5625  putative deaminase-reductase  52.76 
 
 		 190 aa  169  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4493  bifunctional deaminase-reductase-like protein  45.33 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3337  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3399  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3348  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1260  DNA-binding protein  45.21 
 
 		 215 aa  165  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.933847  normal  0.428318 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  44.88 
 
 		 201 aa  161  7e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0434  bifunctional deaminase-reductase-like protein  45.9 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1614  hypothetical protein  43.12 
 
 		 216 aa  159  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.225791 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  50.56 
 
 		 199 aa  157  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  44.75 
 
 		 219 aa  155  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6622  DNA-binding protein  50.62 
 
 		 200 aa  149  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02020  dihydrofolate reductase  41.3 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.95 
 
 		 370 aa  132  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1876  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.72 
 
 		 206 aa  132  6e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.02 
 
 		 206 aa  131  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.1 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  37.86 
 
 		 222 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  38.42 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.15 
 
 		 206 aa  125  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.04 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.88 
 
 		 212 aa  108  8.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.44 
 
 		 197 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4462  deaminase-reductase domain-containing protein  36.07 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.45 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  32.79 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.25 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8364  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.9 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  29.21 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  34.48 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.21 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.05 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7746  hypothetical protein  27.05 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  36.22 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  32.8 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5268  hypothetical protein  28.77 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  33.58 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  32 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.48 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  24.47 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  29.57 
 
 		 182 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.03 
 
 		 179 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  29.05 
 
 		 183 aa  51.6  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3340  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  27.93 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  26.32 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  29.61 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  29.61 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  29.05 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.05 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.18 
 
 		 184 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.11 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4077  dihydrofolate reductase  28 
 
 		 172 aa  49.7  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2685  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.48 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2032  riboflavin biosynthesis protein RibD  31.58 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.995676  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.91 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.94 
 
 		 186 aa  48.5  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  26.88 
 
 		 180 aa  48.5  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  30.23 
 
 		 180 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  24.48 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  24.48 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  25.21 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.46 
 
 		 180 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.94 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  22.94 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.99 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  24.47 
 
 		 173 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  29.32 
 
 		 390 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  28.06 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>