87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1614 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1614  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  433  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.225791 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  81.48 
 
 		 219 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  74.54 
 
 		 370 aa  282  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  50.92 
 
 		 217 aa  191  8e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  46.79 
 
 		 223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  49.31 
 
 		 213 aa  181  8.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00121838  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0378  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.45 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1818  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.93 
 
 		 211 aa  176  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450783  hitchhiker  0.00922336 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3505  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.17 
 
 		 219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000551807  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.45 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5453  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  45.62 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  45.41 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.21 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.21 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1051  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.26 
 
 		 218 aa  165  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0782289  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  44.75 
 
 		 215 aa  164  6.9999999999999995e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.29 
 
 		 219 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.64 
 
 		 220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  42.01 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  43.12 
 
 		 215 aa  159  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  40.37 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  45.45 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  43.58 
 
 		 215 aa  154  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  42.73 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6866  deaminase-reductase domain-containing protein  43.33 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.9 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3337  DNA-binding protein  43.69 
 
 		 216 aa  144  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3399  DNA-binding protein  43.69 
 
 		 216 aa  144  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3348  DNA-binding protein  43.69 
 
 		 216 aa  144  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2668  DNA-binding protein  44.55 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0510  deaminase-reductase domain-containing protein  41.59 
 
 		 227 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.120308  normal  0.164935 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02020  dihydrofolate reductase  42.4 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6197  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.2 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2571  deaminase-reductase domain-containing protein  44.09 
 
 		 217 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0434  bifunctional deaminase-reductase-like protein  41.44 
 
 		 214 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4493  bifunctional deaminase-reductase-like protein  41.23 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1260  DNA-binding protein  39.91 
 
 		 215 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.933847  normal  0.428318 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2224  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.81 
 
 		 213 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6622  DNA-binding protein  48.77 
 
 		 200 aa  122  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.18 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5625  putative deaminase-reductase  42.35 
 
 		 190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.32 
 
 		 206 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.38 
 
 		 201 aa  112  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  38.16 
 
 		 222 aa  111  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.74 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  34.4 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  36 
 
 		 212 aa  98.6  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  34.65 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1876  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.95 
 
 		 206 aa  95.5  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.98 
 
 		 211 aa  94.7  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.47 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.86 
 
 		 206 aa  84.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.65 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.75 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  30.77 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8364  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.37 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.41 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  28.04 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  34.17 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  30.97 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.42 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.89 
 
 		 180 aa  51.2  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  26.8 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  42.03 
 
 		 178 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.61 
 
 		 177 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  33.61 
 
 		 177 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2640  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.25 
 
 		 187 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.77 
 
 		 177 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  26.27 
 
 		 176 aa  47  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7653  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.64 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2032  riboflavin biosynthesis protein RibD  30.32 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.995676  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4462  deaminase-reductase domain-containing protein  29.38 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5268  hypothetical protein  29.7 
 
 		 194 aa  45.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  30.85 
 
 		 199 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.58 
 
 		 179 aa  45.1  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14580  dihydrofolate reductase  34.19 
 
 		 184 aa  45.1  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  27.13 
 
 		 193 aa  45.1  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  28.35 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  25 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  27.52 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  27.6 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.89 
 
 		 184 aa  43.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.33 
 
 		 173 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1962  deaminase-reductase domain-containing protein  25.13 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 		 175 aa  42.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.14 
 
 		 204 aa  42  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.89 
 
 		 180 aa  41.6  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>