169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3939 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 		 206 aa  412  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  70 
 
 		 222 aa  308  2.9999999999999997e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  68.33 
 
 		 221 aa  303  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  50.24 
 
 		 212 aa  213  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.53 
 
 		 206 aa  198  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.58 
 
 		 220 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.58 
 
 		 220 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.47 
 
 		 240 aa  146  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.37 
 
 		 211 aa  145  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  40.29 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.1 
 
 		 220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  40.19 
 
 		 214 aa  142  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  45.36 
 
 		 215 aa  141  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.09 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.86 
 
 		 220 aa  138  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  39.41 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6197  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.6 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  40.39 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.35 
 
 		 213 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  39.02 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  37.02 
 
 		 215 aa  131  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.86 
 
 		 214 aa  131  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  39.3 
 
 		 214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2571  deaminase-reductase domain-containing protein  41.38 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  38.35 
 
 		 217 aa  125  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  41.51 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6866  deaminase-reductase domain-containing protein  40.59 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0510  deaminase-reductase domain-containing protein  38.86 
 
 		 227 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.120308  normal  0.164935 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.06 
 
 		 199 aa  122  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5453  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  37.14 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.79 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00121838  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.05 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2224  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.25 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  40.19 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1818  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.92 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450783  hitchhiker  0.00922336 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1614  hypothetical protein  38.32 
 
 		 216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.225791 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.02 
 
 		 199 aa  112  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  36.45 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0378  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.93 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3337  DNA-binding protein  42.48 
 
 		 216 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3399  DNA-binding protein  42.48 
 
 		 216 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3505  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.91 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000551807  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3348  DNA-binding protein  42.48 
 
 		 216 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2668  DNA-binding protein  37.82 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7746  hypothetical protein  34.16 
 
 		 194 aa  95.9  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1051  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.06 
 
 		 218 aa  96.3  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0782289  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  37.75 
 
 		 193 aa  95.5  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1876  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.28 
 
 		 206 aa  95.1  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5625  putative deaminase-reductase  40.37 
 
 		 190 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  32.65 
 
 		 187 aa  92.8  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0434  bifunctional deaminase-reductase-like protein  41.79 
 
 		 214 aa  91.7  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.89 
 
 		 197 aa  91.3  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1260  DNA-binding protein  37.42 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.933847  normal  0.428318 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  35.44 
 
 		 193 aa  90.5  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6622  DNA-binding protein  39.74 
 
 		 200 aa  90.5  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  36 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4493  bifunctional deaminase-reductase-like protein  37.8 
 
 		 214 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8364  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.73 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.46 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  33.17 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5268  hypothetical protein  34.48 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  35.24 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.66 
 
 		 180 aa  77.4  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4462  deaminase-reductase domain-containing protein  33.5 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02020  dihydrofolate reductase  36.43 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.16 
 
 		 370 aa  76.3  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  33.64 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.44 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3583  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.45 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255249  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.73 
 
 		 180 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  35.9 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2032  riboflavin biosynthesis protein RibD  30.81 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.995676  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  25.57 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3340  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.47 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.94 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  28.5 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.77 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  34.21 
 
 		 180 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  24.39 
 
 		 173 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25060  dihydrofolate reductase  28.81 
 
 		 193 aa  52.8  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.27 
 
 		 175 aa  52.4  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.37 
 
 		 184 aa  52.4  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  27.66 
 
 		 183 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.68 
 
 		 182 aa  51.2  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.58 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  22.22 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.72 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  21.59 
 
 		 173 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.41 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.21 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25 
 
 		 180 aa  49.3  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.49 
 
 		 188 aa  48.5  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  21.02 
 
 		 174 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14580  dihydrofolate reductase  44.78 
 
 		 184 aa  48.1  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14470  dihydrofolate reductase  36.17 
 
 		 183 aa  48.1  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  23.73 
 
 		 173 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.26 
 
 		 177 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  40.91 
 
 		 178 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  34.26 
 
 		 177 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  34.48 
 
 		 193 aa  48.1  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>