115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0636 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 
201 aa  411  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  54.08 
 
 
201 aa  192  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  50.48 
 
 
220 aa  191  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  50.48 
 
 
220 aa  191  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  54.77 
 
 
199 aa  189  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  48.82 
 
 
215 aa  187  9e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  49.75 
 
 
213 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2224  bifunctional deaminase-reductase domain protein  50.75 
 
 
213 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  47.34 
 
 
215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  47.32 
 
 
215 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6866  deaminase-reductase domain-containing protein  50.49 
 
 
210 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2571  deaminase-reductase domain-containing protein  54.89 
 
 
217 aa  176  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.39 
 
 
219 aa  174  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  46.27 
 
 
213 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0510  deaminase-reductase domain-containing protein  47.42 
 
 
227 aa  173  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.120308  normal  0.164935 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.6 
 
 
220 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  46.15 
 
 
214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  44.88 
 
 
215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1876  bifunctional deaminase-reductase domain protein  49.27 
 
 
206 aa  171  7.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6197  bifunctional deaminase-reductase domain protein  49.28 
 
 
218 aa  171  9e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  45.75 
 
 
221 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.79 
 
 
220 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.07 
 
 
214 aa  167  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  44.44 
 
 
214 aa  163  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  45.21 
 
 
217 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  44.62 
 
 
223 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1051  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.9 
 
 
218 aa  136  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0782289  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.29 
 
 
240 aa  136  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3505  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.45 
 
 
219 aa  135  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000551807  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0378  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.71 
 
 
219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5625  putative deaminase-reductase  47.98 
 
 
190 aa  130  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.91 
 
 
206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.21 
 
 
213 aa  124  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00121838  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5453  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  39.66 
 
 
210 aa  123  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  37.25 
 
 
221 aa  121  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.81 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1818  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.25 
 
 
211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450783  hitchhiker  0.00922336 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.45 
 
 
206 aa  118  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3337  DNA-binding protein  38.04 
 
 
216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3399  DNA-binding protein  38.04 
 
 
216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3348  DNA-binding protein  38.04 
 
 
216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  36.61 
 
 
222 aa  111  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1614  hypothetical protein  34.86 
 
 
216 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.225791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6622  DNA-binding protein  45.95 
 
 
200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4462  deaminase-reductase domain-containing protein  38.28 
 
 
202 aa  108  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1260  DNA-binding protein  37.14 
 
 
215 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.933847  normal  0.428318 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
219 aa  105  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02020  dihydrofolate reductase  38.55 
 
 
230 aa  104  9e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2668  DNA-binding protein  48.7 
 
 
214 aa  103  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4493  bifunctional deaminase-reductase-like protein  41.18 
 
 
214 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.73 
 
 
212 aa  100  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.5 
 
 
197 aa  94.7  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0434  bifunctional deaminase-reductase-like protein  41.38 
 
 
214 aa  93.2  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.99 
 
 
180 aa  93.2  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8364  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.88 
 
 
213 aa  89.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  37.06 
 
 
215 aa  88.2  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.45 
 
 
206 aa  87.8  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.69 
 
 
370 aa  87.4  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  30.3 
 
 
180 aa  79  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  33.49 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  33.87 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.03 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  31.82 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.76 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2032  riboflavin biosynthesis protein RibD  34.83 
 
 
218 aa  68.2  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.995676  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7746  hypothetical protein  30.65 
 
 
194 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  31.58 
 
 
193 aa  67  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5268  hypothetical protein  32.7 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  31.58 
 
 
193 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3583  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.07 
 
 
197 aa  61.2  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255249  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.71 
 
 
184 aa  60.1  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  30.73 
 
 
180 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.1 
 
 
180 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3340  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.75 
 
 
185 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.86 
 
 
181 aa  56.6  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  27.64 
 
 
178 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  29 
 
 
178 aa  51.6  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  29.53 
 
 
182 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  27.78 
 
 
199 aa  50.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.31 
 
 
186 aa  49.7  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.89 
 
 
178 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05750  dihydrofolate reductase  29.17 
 
 
213 aa  48.9  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222473  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  28.9 
 
 
183 aa  48.1  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.17 
 
 
187 aa  48.1  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.35 
 
 
188 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.27 
 
 
179 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  27.65 
 
 
183 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  25.74 
 
 
177 aa  46.6  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  27.65 
 
 
183 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.46 
 
 
183 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  23.56 
 
 
204 aa  45.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.71 
 
 
181 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  27.65 
 
 
183 aa  45.1  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  27.27 
 
 
180 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3108  deaminase-reductase domain-containing protein  29.24 
 
 
207 aa  44.7  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0380037  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.06 
 
 
183 aa  45.1  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.14 
 
 
183 aa  45.1  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  25.68 
 
 
199 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.42 
 
 
201 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5564  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.84 
 
 
188 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>