79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1876 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1876  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
206 aa  412  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  55.5 
 
 
199 aa  182  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  49.27 
 
 
201 aa  165  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.22 
 
 
201 aa  147  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  44.14 
 
 
215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  43.84 
 
 
215 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  46.32 
 
 
215 aa  144  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6866  deaminase-reductase domain-containing protein  45.15 
 
 
210 aa  141  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.96 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.18 
 
 
220 aa  139  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  42.41 
 
 
217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.01 
 
 
214 aa  138  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42 
 
 
220 aa  137  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.98 
 
 
220 aa  137  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.98 
 
 
220 aa  137  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.92 
 
 
213 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  43.24 
 
 
213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  43.72 
 
 
221 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0510  deaminase-reductase domain-containing protein  40.64 
 
 
227 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.120308  normal  0.164935 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  38.81 
 
 
214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  39.91 
 
 
214 aa  132  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  43.72 
 
 
215 aa  132  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1051  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.92 
 
 
218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0782289  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6197  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.21 
 
 
218 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2571  deaminase-reductase domain-containing protein  42.86 
 
 
217 aa  125  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0378  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.29 
 
 
219 aa  122  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  37.44 
 
 
223 aa  121  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2224  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.21 
 
 
213 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3399  DNA-binding protein  39.09 
 
 
216 aa  118  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3337  DNA-binding protein  39.09 
 
 
216 aa  118  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3348  DNA-binding protein  39.09 
 
 
216 aa  118  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5625  putative deaminase-reductase  44.83 
 
 
190 aa  115  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2668  DNA-binding protein  39.35 
 
 
214 aa  114  8.999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3505  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.18 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000551807  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.21 
 
 
213 aa  112  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00121838  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1260  DNA-binding protein  38.42 
 
 
215 aa  111  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.933847  normal  0.428318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5453  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  37.44 
 
 
210 aa  109  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4493  bifunctional deaminase-reductase-like protein  36.94 
 
 
214 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.17 
 
 
240 aa  105  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1818  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.04 
 
 
211 aa  105  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450783  hitchhiker  0.00922336 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.88 
 
 
206 aa  105  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02020  dihydrofolate reductase  38.3 
 
 
230 aa  104  8e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0434  bifunctional deaminase-reductase-like protein  38.04 
 
 
214 aa  104  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  40 
 
 
219 aa  97.1  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.67 
 
 
211 aa  96.3  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.77 
 
 
212 aa  96.3  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1614  hypothetical protein  37.95 
 
 
216 aa  95.5  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.225791 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.62 
 
 
206 aa  95.1  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8364  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.93 
 
 
213 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  41.26 
 
 
222 aa  90.5  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6622  DNA-binding protein  47.5 
 
 
200 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  39.86 
 
 
221 aa  86.3  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.58 
 
 
206 aa  85.5  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.83 
 
 
370 aa  72.8  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.38 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.83 
 
 
180 aa  62  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.54 
 
 
215 aa  61.6  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  29.56 
 
 
180 aa  59.3  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  32.8 
 
 
197 aa  58.9  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  28.98 
 
 
187 aa  58.5  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.7 
 
 
199 aa  58.2  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  39.19 
 
 
193 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  29.33 
 
 
193 aa  55.1  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  45.92 
 
 
193 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4462  deaminase-reductase domain-containing protein  32.24 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.15 
 
 
182 aa  52  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7746  hypothetical protein  32.91 
 
 
194 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2032  riboflavin biosynthesis protein RibD  30.29 
 
 
218 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.995676  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3583  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.05 
 
 
197 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255249  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  26.27 
 
 
203 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  42.86 
 
 
199 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.8 
 
 
178 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.97 
 
 
181 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  36.9 
 
 
228 aa  42.4  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  27.41 
 
 
180 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.36 
 
 
183 aa  42  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.15 
 
 
180 aa  42  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36240  riboflavin biosynthesis protein RibD  27.89 
 
 
372 aa  42  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.551062  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5268  hypothetical protein  27.89 
 
 
194 aa  41.2  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>