65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5625 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5625  putative deaminase-reductase  100 
 
 		 190 aa  386  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6866  deaminase-reductase domain-containing protein  87.58 
 
 		 210 aa  278  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  64.81 
 
 		 213 aa  207  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  65.24 
 
 		 213 aa  206  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  53.23 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  59.15 
 
 		 220 aa  191  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  59.15 
 
 		 220 aa  191  7e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2571  deaminase-reductase domain-containing protein  58.72 
 
 		 217 aa  189  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  55.15 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  56.1 
 
 		 220 aa  184  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  52.76 
 
 		 215 aa  181  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2224  bifunctional deaminase-reductase domain protein  60.37 
 
 		 213 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  55.23 
 
 		 219 aa  178  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  53.8 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  56.14 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  54.07 
 
 		 220 aa  177  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6197  bifunctional deaminase-reductase domain protein  56.97 
 
 		 218 aa  174  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  51.96 
 
 		 214 aa  173  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0510  deaminase-reductase domain-containing protein  54.91 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.120308  normal  0.164935 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  53.37 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  51.53 
 
 		 217 aa  158  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.78 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.97 
 
 		 201 aa  143  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1051  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.53 
 
 		 218 aa  137  7e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0782289  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3505  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.59 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000551807  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  46.95 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0378  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.99 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  47.4 
 
 		 201 aa  131  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  49.08 
 
 		 199 aa  128  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1614  hypothetical protein  44.71 
 
 		 216 aa  124  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.225791 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1876  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.83 
 
 		 206 aa  124  8.000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.29 
 
 		 213 aa  124  9e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00121838  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2668  DNA-binding protein  45.68 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5453  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  44.72 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  45.73 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1818  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.21 
 
 		 211 aa  118  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450783  hitchhiker  0.00922336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4493  bifunctional deaminase-reductase-like protein  42.11 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1260  DNA-binding protein  39.66 
 
 		 215 aa  114  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.933847  normal  0.428318 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3399  DNA-binding protein  42.14 
 
 		 216 aa  114  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3348  DNA-binding protein  42.14 
 
 		 216 aa  114  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3337  DNA-binding protein  42.14 
 
 		 216 aa  114  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  40.11 
 
 		 222 aa  111  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.86 
 
 		 206 aa  107  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6622  DNA-binding protein  47.06 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  37.63 
 
 		 221 aa  101  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0434  bifunctional deaminase-reductase-like protein  38.99 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.89 
 
 		 211 aa  99  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.42 
 
 		 370 aa  98.2  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02020  dihydrofolate reductase  42.73 
 
 		 230 aa  96.3  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.25 
 
 		 206 aa  91.7  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.76 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.69 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  30.19 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.62 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  34.18 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4462  deaminase-reductase domain-containing protein  31.84 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.58 
 
 		 199 aa  57.8  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.83 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  31.09 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.67 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8364  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.17 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.72 
 
 		 180 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  31.62 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  47.73 
 
 		 199 aa  42.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  31.9 
 
 		 193 aa  42.4  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>