154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4462 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4462  deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 		 202 aa  398  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  38.28 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.81 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.48 
 
 		 240 aa  104  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.14 
 
 		 220 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.14 
 
 		 220 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  36.07 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  37.86 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  38.35 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  37.62 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.76 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.55 
 
 		 220 aa  95.5  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  34.95 
 
 		 197 aa  92.4  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.48 
 
 		 220 aa  92  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  34.11 
 
 		 221 aa  91.7  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  31.88 
 
 		 180 aa  91.3  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.42 
 
 		 219 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.5 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.88 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.22 
 
 		 201 aa  89  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.9 
 
 		 215 aa  88.2  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  31.34 
 
 		 221 aa  87.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  33.81 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.78 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.03 
 
 		 199 aa  85.5  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  35.02 
 
 		 223 aa  85.1  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.02 
 
 		 213 aa  84.7  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  39.08 
 
 		 193 aa  84.7  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.28 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1818  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.52 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450783  hitchhiker  0.00922336 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  37.09 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  32.72 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.93 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6866  deaminase-reductase domain-containing protein  35.71 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  31.88 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5453  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.82 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.69 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00121838  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2224  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.86 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2571  deaminase-reductase domain-containing protein  37.79 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0510  deaminase-reductase domain-containing protein  35.94 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.120308  normal  0.164935 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0378  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.8 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6197  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.2 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4493  bifunctional deaminase-reductase-like protein  36.81 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3337  DNA-binding protein  35.54 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3399  DNA-binding protein  35.54 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3348  DNA-binding protein  35.54 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  31.8 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3583  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.46 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  30.11 
 
 		 193 aa  72  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7746  hypothetical protein  29.8 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5268  hypothetical protein  29.61 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2032  riboflavin biosynthesis protein RibD  29.5 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.995676  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.95 
 
 		 180 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1876  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.24 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2668  DNA-binding protein  37.04 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.18 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1260  DNA-binding protein  34.07 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.933847  normal  0.428318 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1051  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.35 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0782289  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3505  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.58 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000551807  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  32.67 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0434  bifunctional deaminase-reductase-like protein  36.88 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.71 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5625  putative deaminase-reductase  31.84 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  30.73 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2144  deaminase-reductase domain-containing protein  32.31 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542593 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.77 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.75 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  26.06 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6622  DNA-binding protein  32.58 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  28.64 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02020  dihydrofolate reductase  32.85 
 
 		 230 aa  53.9  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  39.36 
 
 		 219 aa  52.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1150  dihydrofolate reductase-like protein  31.9 
 
 		 169 aa  52.4  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1614  hypothetical protein  29.38 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.225791 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.08 
 
 		 181 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.2 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1305  dihydrofolate reductase-like protein  31.9 
 
 		 169 aa  52  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8364  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.07 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09530  dihydrofolate reductase  30.85 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.170117  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14580  dihydrofolate reductase  35.25 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  26.47 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  27.13 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  32.56 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  32.11 
 
 		 183 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  29.03 
 
 		 178 aa  48.9  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  30.41 
 
 		 192 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  28.09 
 
 		 182 aa  48.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  35.11 
 
 		 173 aa  48.1  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  25.98 
 
 		 174 aa  48.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14470  dihydrofolate reductase  36.94 
 
 		 183 aa  47.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  33.82 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  28.35 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  25.76 
 
 		 173 aa  47  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3108  deaminase-reductase domain-containing protein  31.06 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0380037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.5 
 
 		 177 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.82 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.15 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.78 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>