86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_09530 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_09530  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 193 aa  385  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.170117  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3340  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  38.92 
 
 		 185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.22 
 
 		 180 aa  95.1  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  37.91 
 
 		 180 aa  93.2  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  30.27 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.76 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0378  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.96 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.63 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.66 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.7 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  29.45 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.68 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  29.82 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.67 
 
 		 176 aa  52.4  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.63 
 
 		 182 aa  52.4  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  25.17 
 
 		 174 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.49 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.28 
 
 		 220 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  34.69 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  25.17 
 
 		 173 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  25.17 
 
 		 174 aa  49.7  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  25.17 
 
 		 173 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  32.32 
 
 		 182 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.28 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.77 
 
 		 173 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  30.77 
 
 		 193 aa  48.9  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4493  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.18 
 
 		 214 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.28 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  28.35 
 
 		 183 aa  48.5  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  24.48 
 
 		 173 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  29.03 
 
 		 223 aa  48.9  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.22 
 
 		 190 aa  48.5  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  25.49 
 
 		 180 aa  48.5  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7653  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.37 
 
 		 187 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1051  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.57 
 
 		 218 aa  48.1  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0782289  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.37 
 
 		 199 aa  47.8  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  30.3 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.49 
 
 		 178 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  30.43 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5453  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  38.75 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.16 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.68 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3583  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.78 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255249  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  23.78 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  29.49 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.75 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00121838  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.79 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.79 
 
 		 185 aa  45.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0204  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.74 
 
 		 186 aa  45.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  30.54 
 
 		 193 aa  44.7  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1260  DNA-binding protein  30.43 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.933847  normal  0.428318 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3505  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.85 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000551807  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.88 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  27.6 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5268  hypothetical protein  31.14 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5086  bifunctional deaminase-reductase-like  28.29 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  23.33 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.26 
 
 		 240 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  35.44 
 
 		 228 aa  43.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  35 
 
 		 217 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.38 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.37 
 
 		 213 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.23 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.48 
 
 		 187 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.49 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0431  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.87 
 
 		 173 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.84 
 
 		 188 aa  42.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02020  dihydrofolate reductase  28.4 
 
 		 230 aa  42.4  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 		 182 aa  42  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0711  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.37 
 
 		 176 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0366042  normal  0.491773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1194  deaminase-reductase domain-containing protein  30.2 
 
 		 186 aa  42.4  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  26.32 
 
 		 197 aa  42  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1850  bifunctional deaminase-reductase-like  26.32 
 
 		 176 aa  42.4  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.184998 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  21.39 
 
 		 194 aa  42  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  28.74 
 
 		 196 aa  41.6  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  24.48 
 
 		 173 aa  41.6  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.3 
 
 		 210 aa  41.6  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  24.48 
 
 		 173 aa  41.6  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  22.7 
 
 		 181 aa  41.6  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1785  deaminase-reductase domain-containing protein  29.68 
 
 		 177 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.67 
 
 		 214 aa  41.6  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6294  bifunctional deaminase-reductase-like  29.68 
 
 		 177 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2668  DNA-binding protein  27.96 
 
 		 214 aa  41.2  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25 
 
 		 188 aa  41.2  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.169407 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>