172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3340 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3340  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 		 185 aa  377  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09530  dihydrofolate reductase  38.92 
 
 		 193 aa  118  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.170117  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.57 
 
 		 180 aa  117  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  39.77 
 
 		 180 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.28 
 
 		 180 aa  88.2  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.81 
 
 		 215 aa  86.3  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.55 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.97 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  31.84 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.98 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  33.55 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  30.59 
 
 		 187 aa  72  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.15 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  31.03 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.93 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2032  riboflavin biosynthesis protein RibD  32.81 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.995676  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5268  hypothetical protein  29.24 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.61 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1818  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.02 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450783  hitchhiker  0.00922336 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.85 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  34.01 
 
 		 180 aa  60.8  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  23.98 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.28 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.28 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.17 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.88 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.28 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  26.01 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.99 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.87 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  27.22 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  27.98 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.28 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2224  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.28 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  29.05 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.22 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.72 
 
 		 188 aa  57  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.2 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  24.86 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.47 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  25.29 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  25.29 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.48 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  29.71 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.87 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  29.05 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.39 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  25.29 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  28.49 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  31.33 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  25.43 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.86 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.03 
 
 		 177 aa  53.9  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  29.38 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  25.57 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  24.28 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.27 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.82 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00121838  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3337  DNA-binding protein  27.07 
 
 		 216 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3399  DNA-binding protein  27.07 
 
 		 216 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.49 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3348  DNA-binding protein  27.07 
 
 		 216 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  30.18 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.2 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.15 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.97 
 
 		 178 aa  52.4  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  29.05 
 
 		 213 aa  52.4  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3583  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.06 
 
 		 197 aa  52.4  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  31.58 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  32.08 
 
 		 178 aa  52  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  28.32 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  27.21 
 
 		 172 aa  52  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4077  dihydrofolate reductase  25.52 
 
 		 172 aa  52  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  29.73 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  27.46 
 
 		 221 aa  51.6  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  27.93 
 
 		 215 aa  51.2  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.79 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.81 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4615  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.15 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.308446 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.95 
 
 		 220 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  24.28 
 
 		 173 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  30.56 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.97 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14580  dihydrofolate reductase  29.61 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3842  bifunctional deaminase-reductase-like protein  26.99 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.54 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  29.25 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.78 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  26.21 
 
 		 390 aa  48.9  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2640  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  26.62 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2685  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.05 
 
 		 212 aa  48.5  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.66 
 
 		 176 aa  48.9  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  24.59 
 
 		 212 aa  48.1  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4493  bifunctional deaminase-reductase-like protein  26.37 
 
 		 214 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.49 
 
 		 187 aa  48.1  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0431  bifunctional deaminase-reductase-like protein  24.48 
 
 		 173 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.56 
 
 		 177 aa  47.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  29.44 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  28.26 
 
 		 221 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>