More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0878 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 		 180 aa  362  2e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  36.47 
 
 		 183 aa  129  3e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.31 
 
 		 184 aa  120  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  37.1 
 
 		 199 aa  116  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  34.88 
 
 		 176 aa  114  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.84 
 
 		 182 aa  111  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.71 
 
 		 175 aa  111  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  35.47 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.75 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  36.47 
 
 		 174 aa  106  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  32.94 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  38.95 
 
 		 173 aa  104  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  35.76 
 
 		 180 aa  104  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.24 
 
 		 188 aa  102  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  33.9 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1194  deaminase-reductase domain-containing protein  38.2 
 
 		 186 aa  101  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2144  deaminase-reductase domain-containing protein  34.12 
 
 		 180 aa  101  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542593 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  33.93 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.71 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5103  putative deaminase-reductase  33.71 
 
 		 177 aa  98.6  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.81615 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2685  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.72 
 
 		 212 aa  96.7  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  32.35 
 
 		 174 aa  95.9  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.09 
 
 		 181 aa  94.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.5 
 
 		 176 aa  94.4  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  31.18 
 
 		 173 aa  94.4  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  31.76 
 
 		 173 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6294  bifunctional deaminase-reductase-like  33.52 
 
 		 177 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1785  deaminase-reductase domain-containing protein  33.52 
 
 		 177 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  31.76 
 
 		 173 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  31.76 
 
 		 173 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  31.18 
 
 		 173 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  31.18 
 
 		 174 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0286  bifunctional deaminase-reductase-like  31.18 
 
 		 178 aa  92  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  34.12 
 
 		 192 aa  92  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.88 
 
 		 193 aa  91.3  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3715  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.66 
 
 		 178 aa  91.3  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  31.18 
 
 		 173 aa  90.9  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  31.18 
 
 		 173 aa  90.9  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  31.18 
 
 		 173 aa  90.9  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 193 aa  89.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1910  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  33.53 
 
 		 199 aa  89  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  32 
 
 		 183 aa  88.2  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5086  bifunctional deaminase-reductase-like  32.95 
 
 		 177 aa  87.8  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  40 
 
 		 177 aa  87.4  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  32 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  32 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  32 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  33.7 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  32.58 
 
 		 178 aa  86.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.43 
 
 		 183 aa  85.5  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  33.92 
 
 		 178 aa  85.5  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.51 
 
 		 188 aa  85.1  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  32.22 
 
 		 180 aa  84.7  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.25 
 
 		 178 aa  84.7  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.87 
 
 		 177 aa  84.3  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.6 
 
 		 183 aa  84.3  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  31.91 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  32.61 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  32.4 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1969  hypothetical protein  31.67 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1963  hypothetical protein  30.11 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4077  dihydrofolate reductase  33.55 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.71 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.75 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2640  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.75 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.73 
 
 		 186 aa  80.9  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.11 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14470  dihydrofolate reductase  31.15 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3970  deaminase-reductase domain-containing protein  27.53 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  31.29 
 
 		 173 aa  77.8  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  30.41 
 
 		 177 aa  77.4  0.00000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.26 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5750  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.14 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  27.42 
 
 		 180 aa  77.4  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2481  bifunctional deaminase-reductase-like  29.31 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.65 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.22 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  29.22 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3108  deaminase-reductase domain-containing protein  34.3 
 
 		 207 aa  74.3  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0380037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  28.8 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  25.95 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.41 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.95 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  29.95 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  30.21 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.35 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.57 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  33.74 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0431  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.01 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  29.95 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  29.1 
 
 		 195 aa  70.9  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14580  dihydrofolate reductase  34.38 
 
 		 184 aa  70.9  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  26.88 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.65 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  27.32 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  27.27 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2397  dihydrofolate reductase  37.5 
 
 		 116 aa  67  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.32 
 
 		 185 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>