233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_14580 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_14580  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 184 aa  365  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  50.83 
 
 		 196 aa  171  5.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3614  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.27 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33338  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2685  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.51 
 
 		 212 aa  139  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03197  dihydrofolate reductase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G06820)  41.71 
 
 		 210 aa  131  5e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.245608 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3715  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.55 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1969  hypothetical protein  41.34 
 
 		 181 aa  129  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5750  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  46.2 
 
 		 176 aa  128  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1963  hypothetical protein  40.78 
 
 		 181 aa  128  6e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3108  deaminase-reductase domain-containing protein  41.53 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0380037  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  37.1 
 
 		 390 aa  118  6e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  40.54 
 
 		 173 aa  115  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0286  bifunctional deaminase-reductase-like  37.43 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.12 
 
 		 181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2144  deaminase-reductase domain-containing protein  37.02 
 
 		 180 aa  107  9.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542593 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  37.7 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  38.25 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  37.7 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  40.13 
 
 		 177 aa  105  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  37.16 
 
 		 183 aa  105  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.07 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5103  putative deaminase-reductase  40.66 
 
 		 177 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.81615 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.16 
 
 		 183 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1910  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  38.25 
 
 		 199 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2481  bifunctional deaminase-reductase-like  38.8 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  38.76 
 
 		 180 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6294  bifunctional deaminase-reductase-like  38.64 
 
 		 177 aa  97.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1785  deaminase-reductase domain-containing protein  38.64 
 
 		 177 aa  97.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5086  bifunctional deaminase-reductase-like  37.87 
 
 		 177 aa  96.7  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  40.88 
 
 		 178 aa  96.7  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  34.22 
 
 		 181 aa  95.5  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  38.85 
 
 		 178 aa  94.7  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  37.08 
 
 		 180 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  38.85 
 
 		 177 aa  92.4  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  35.62 
 
 		 173 aa  90.1  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  35.62 
 
 		 173 aa  90.1  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.49 
 
 		 188 aa  90.1  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  35.62 
 
 		 173 aa  90.1  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.71 
 
 		 177 aa  89  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  34.59 
 
 		 173 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.25 
 
 		 184 aa  87  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  34.38 
 
 		 173 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.87 
 
 		 184 aa  87.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  33.75 
 
 		 173 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  33.75 
 
 		 173 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  33.12 
 
 		 173 aa  85.1  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  33.12 
 
 		 174 aa  84.7  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  31.11 
 
 		 172 aa  84.7  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  32.63 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  32.6 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  36.36 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.44 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  34.87 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  31.87 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.21 
 
 		 182 aa  72  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  31.14 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  27.78 
 
 		 174 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.51 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.31 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.74 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.11 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.11 
 
 		 183 aa  62  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.05 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.41 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  31.76 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  31.46 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  27.68 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  31.37 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  31.06 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.95 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.76 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.53 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.5 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.1 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.37 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  30 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  27.23 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  29.27 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.7 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  33.09 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.27 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  22.75 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2627  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.5 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.58 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  31.58 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1194  deaminase-reductase domain-containing protein  30.61 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18140  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase /5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  30.59 
 
 		 393 aa  53.9  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0431  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  30.19 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 215 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  29.5 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2049  bifunctional deaminase-reductase-like  30.14 
 
 		 175 aa  52.8  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5956  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.13 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2749  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.48 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0206598 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  23.5 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.56 
 
 		 177 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  31.68 
 
 		 222 aa  52  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>