125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2307 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 		 212 aa  436  1e-121  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  52.34 
 
 		 222 aa  228  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  53.27 
 
 		 221 aa  221  4e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  50.24 
 
 		 206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.33 
 
 		 206 aa  165  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.12 
 
 		 240 aa  144  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.22 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  36.94 
 
 		 215 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  39.46 
 
 		 223 aa  127  8.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  37.39 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.28 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.14 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  37.39 
 
 		 214 aa  121  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  38.53 
 
 		 215 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.32 
 
 		 213 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6197  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.77 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.94 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.94 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.84 
 
 		 219 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.8 
 
 		 220 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.69 
 
 		 201 aa  113  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  34.51 
 
 		 221 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2571  deaminase-reductase domain-containing protein  39.13 
 
 		 217 aa  111  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0378  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.56 
 
 		 219 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  32.72 
 
 		 213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  37.18 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  32.88 
 
 		 215 aa  108  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2668  DNA-binding protein  34.8 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.8 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00121838  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.56 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3337  DNA-binding protein  36.41 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3399  DNA-binding protein  36.41 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3348  DNA-binding protein  36.41 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  34.82 
 
 		 219 aa  102  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2224  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.4 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4493  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.51 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0510  deaminase-reductase domain-containing protein  33.77 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.120308  normal  0.164935 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0434  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.57 
 
 		 214 aa  99.8  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6866  deaminase-reductase domain-containing protein  31.67 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5453  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.74 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1614  hypothetical protein  36 
 
 		 216 aa  98.6  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.225791 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1051  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.02 
 
 		 218 aa  98.2  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0782289  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1818  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.41 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450783  hitchhiker  0.00922336 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3505  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.98 
 
 		 219 aa  96.7  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000551807  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1876  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.77 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.06 
 
 		 199 aa  95.9  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  32.73 
 
 		 201 aa  95.5  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.63 
 
 		 199 aa  93.6  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6622  DNA-binding protein  35.98 
 
 		 200 aa  89.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1260  DNA-binding protein  31.52 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.933847  normal  0.428318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.52 
 
 		 197 aa  84.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02020  dihydrofolate reductase  35.66 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5268  hypothetical protein  31.9 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  35.56 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.13 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  35.81 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8364  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4462  deaminase-reductase domain-containing protein  31.28 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7746  hypothetical protein  29.11 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.84 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  29.56 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.17 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5625  putative deaminase-reductase  32.65 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.03 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.86 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3583  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.71 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255249  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.69 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  26.79 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  32.43 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2032  riboflavin biosynthesis protein RibD  30 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.995676  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  30 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  28.18 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  25 
 
 		 173 aa  54.7  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.49 
 
 		 183 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.49 
 
 		 175 aa  54.7  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  27.17 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.73 
 
 		 177 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  29.75 
 
 		 178 aa  52.4  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.36 
 
 		 177 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  24.56 
 
 		 180 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  29.36 
 
 		 177 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  23.91 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.44 
 
 		 177 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14470  dihydrofolate reductase  37.88 
 
 		 183 aa  49.7  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25060  dihydrofolate reductase  24.61 
 
 		 193 aa  49.3  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.46 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.09 
 
 		 173 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.78 
 
 		 178 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3340  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  24.59 
 
 		 185 aa  48.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  29.03 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  41.51 
 
 		 183 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  24.07 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  25.13 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  27.73 
 
 		 181 aa  46.6  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.72 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.41 
 
 		 181 aa  45.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  30.25 
 
 		 177 aa  46.2  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  26.29 
 
 		 390 aa  45.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  38.3 
 
 		 180 aa  45.4  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  28.17 
 
 		 178 aa  45.1  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>