145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0271 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0271  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
191 aa  388  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.011161  hitchhiker  0.00121534 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5799  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  68.95 
 
 
191 aa  271  4.0000000000000004e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00712237  normal  0.320855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4096  RibD domain protein  55.96 
 
 
192 aa  218  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7185  RibD domain protein  56.84 
 
 
190 aa  216  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3848  dihydrofolate reductase family protein  54.97 
 
 
190 aa  211  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347395  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3207  bifunctional deaminase-reductase domain protein  58.95 
 
 
191 aa  211  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.535635  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32930  dihydrofolate reductase  54.4 
 
 
194 aa  195  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0724  dihydrofolate reductase family protein  52.55 
 
 
197 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.758945 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  48.15 
 
 
193 aa  181  8.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  48.68 
 
 
193 aa  172  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  46.07 
 
 
195 aa  160  8.000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  43.98 
 
 
195 aa  157  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1936  dihydrofolate reductase family protein  46.32 
 
 
191 aa  155  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422248  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2516  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.83 
 
 
189 aa  152  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.367324  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3404  riboflavin biosynthesis protein RibD  46.84 
 
 
196 aa  145  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5023  deaminase-reductase domain-containing protein  41.92 
 
 
198 aa  142  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.499982 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4561  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.13 
 
 
197 aa  142  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0109  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  37.7 
 
 
191 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.38 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.61 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.52 
 
 
177 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  27.84 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  29.69 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  28.48 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  29.11 
 
 
173 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  27.22 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  27.22 
 
 
173 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  27.22 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  27.22 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  27.22 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  27.22 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  27.22 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1850  bifunctional deaminase-reductase-like  29.53 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.184998 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.86 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.57 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  26.56 
 
 
172 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.38 
 
 
174 aa  63.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2049  bifunctional deaminase-reductase-like  31.9 
 
 
175 aa  63.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366919  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  26.75 
 
 
173 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.55 
 
 
178 aa  63.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  26.89 
 
 
228 aa  62.8  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  26.5 
 
 
180 aa  61.6  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  27.67 
 
 
199 aa  60.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  29.69 
 
 
182 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  30.49 
 
 
180 aa  57.8  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  31.07 
 
 
175 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5690  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.86 
 
 
179 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.172276  normal  0.519116 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  25.15 
 
 
183 aa  57  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  25.76 
 
 
200 aa  56.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.46 
 
 
175 aa  55.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.32 
 
 
183 aa  55.1  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.94 
 
 
210 aa  55.1  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  30.18 
 
 
177 aa  54.7  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.44 
 
 
188 aa  55.1  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.56 
 
 
194 aa  54.7  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.82 
 
 
204 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.6 
 
 
209 aa  52.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3814  deaminase-reductase domain-containing protein  25.41 
 
 
205 aa  52.4  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  29.34 
 
 
180 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  26.47 
 
 
183 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  26.47 
 
 
183 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  26.47 
 
 
183 aa  51.6  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  32.84 
 
 
178 aa  51.6  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  29.81 
 
 
178 aa  51.2  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1969  hypothetical protein  27.22 
 
 
181 aa  50.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1963  hypothetical protein  27.22 
 
 
181 aa  50.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  26.77 
 
 
183 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.88 
 
 
183 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.7 
 
 
185 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.02 
 
 
188 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  28.02 
 
 
188 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  27.05 
 
 
199 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25 
 
 
181 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  26.59 
 
 
180 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.06 
 
 
196 aa  50.1  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  26.84 
 
 
173 aa  49.7  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  27.93 
 
 
177 aa  50.1  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  32.62 
 
 
183 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  27.45 
 
 
198 aa  49.3  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  27.5 
 
 
181 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  27.54 
 
 
188 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5750  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.63 
 
 
176 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.79 
 
 
180 aa  48.5  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  24.57 
 
 
181 aa  48.5  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.91 
 
 
186 aa  48.5  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.61 
 
 
192 aa  48.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.25 
 
 
185 aa  48.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.87 
 
 
187 aa  48.1  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  25.13 
 
 
183 aa  47.8  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  25.46 
 
 
196 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6294  bifunctional deaminase-reductase-like  28.88 
 
 
177 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1785  deaminase-reductase domain-containing protein  28.88 
 
 
177 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  28.48 
 
 
192 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.71 
 
 
181 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.61 
 
 
181 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  24.71 
 
 
181 aa  47  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  27.61 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3200  deaminase-reductase domain-containing protein  39.74 
 
 
176 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.24 
 
 
217 aa  46.6  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.24 
 
 
178 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>