119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_32930 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_32930  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 194 aa  397  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4561  bifunctional deaminase-reductase domain protein  55.33 
 
 		 197 aa  209  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0271  bifunctional deaminase-reductase domain protein  54.4 
 
 		 191 aa  195  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.011161  hitchhiker  0.00121534 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5023  deaminase-reductase domain-containing protein  50.51 
 
 		 198 aa  187  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.499982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3207  bifunctional deaminase-reductase domain protein  50.26 
 
 		 191 aa  180  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.535635  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  48.21 
 
 		 193 aa  171  9e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5799  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  47.94 
 
 		 191 aa  171  9e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00712237  normal  0.320855 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  48.19 
 
 		 195 aa  168  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  46.32 
 
 		 193 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  46.88 
 
 		 195 aa  165  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7185  RibD domain protein  46.28 
 
 		 190 aa  162  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4096  RibD domain protein  44.85 
 
 		 192 aa  159  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2516  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.19 
 
 		 189 aa  157  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.367324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0724  dihydrofolate reductase family protein  46.46 
 
 		 197 aa  154  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.758945 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1936  dihydrofolate reductase family protein  45.36 
 
 		 191 aa  154  9e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422248  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3848  dihydrofolate reductase family protein  44.15 
 
 		 190 aa  154  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347395  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3404  riboflavin biosynthesis protein RibD  47.4 
 
 		 196 aa  151  7e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0109  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  40 
 
 		 191 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  31.61 
 
 		 194 aa  90.1  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.3 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5690  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.67 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.172276  normal  0.519116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.05 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.29 
 
 		 178 aa  74.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  26.94 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  28.49 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  27.45 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  28.96 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1850  bifunctional deaminase-reductase-like  29.76 
 
 		 176 aa  67.8  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.184998 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  28.48 
 
 		 174 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2049  bifunctional deaminase-reductase-like  30 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  27.42 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  27.96 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.5 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  27.42 
 
 		 173 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  27.42 
 
 		 173 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  27.08 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  27.42 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  28.49 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.37 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  26.67 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.15 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  30.16 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  27.57 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  31.37 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  25.26 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.23 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.6 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.51 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.63 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.37 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  28.28 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  28.43 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.72 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  23.08 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  29.02 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.36 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  23.56 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.9 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  29.81 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  27.37 
 
 		 180 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.51 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.15 
 
 		 187 aa  52.4  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.49 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  28.57 
 
 		 178 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.64 
 
 		 187 aa  52  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  24.27 
 
 		 183 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.2 
 
 		 177 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.59 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.64 
 
 		 187 aa  49.3  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  27.86 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  26.29 
 
 		 175 aa  48.5  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  28.5 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  24.31 
 
 		 196 aa  48.1  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  25.77 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.25 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3313  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.74 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  34 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  26.11 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1194  deaminase-reductase domain-containing protein  30.19 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  29.71 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  25.89 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.87 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  33.09 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.23 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.37 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.37 
 
 		 186 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5956  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.13 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  29.31 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.04 
 
 		 179 aa  44.7  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.73 
 
 		 187 aa  44.7  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.23 
 
 		 186 aa  44.7  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  26.19 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  23.56 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.74 
 
 		 181 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 183 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.62 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>