161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4096 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4096  RibD domain protein  100 
 
 		 192 aa  391  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3848  dihydrofolate reductase family protein  69.79 
 
 		 190 aa  280  8.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347395  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7185  RibD domain protein  68.59 
 
 		 190 aa  280  9e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0724  dihydrofolate reductase family protein  58.88 
 
 		 197 aa  229  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.758945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3207  bifunctional deaminase-reductase domain protein  58.2 
 
 		 191 aa  228  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.535635  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0271  bifunctional deaminase-reductase domain protein  55.96 
 
 		 191 aa  218  3.9999999999999997e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.011161  hitchhiker  0.00121534 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5799  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  50 
 
 		 191 aa  200  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00712237  normal  0.320855 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  46.88 
 
 		 195 aa  180  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  48.15 
 
 		 193 aa  178  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  46.6 
 
 		 195 aa  176  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  44.81 
 
 		 193 aa  168  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32930  dihydrofolate reductase  44.85 
 
 		 194 aa  159  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2516  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.67 
 
 		 189 aa  155  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.367324  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1936  dihydrofolate reductase family protein  44.79 
 
 		 191 aa  153  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422248  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4561  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.94 
 
 		 197 aa  150  8e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0109  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  39.27 
 
 		 191 aa  144  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5023  deaminase-reductase domain-containing protein  41.71 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.499982 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3404  riboflavin biosynthesis protein RibD  43.01 
 
 		 196 aa  132  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  30.41 
 
 		 194 aa  85.1  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.05 
 
 		 182 aa  85.1  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.93 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  27.64 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  27.22 
 
 		 172 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.97 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1850  bifunctional deaminase-reductase-like  30.46 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.184998 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  28.12 
 
 		 173 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  26.04 
 
 		 173 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.03 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2049  bifunctional deaminase-reductase-like  32.81 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  24.87 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  31.52 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  26.52 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.71 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  27.07 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  26.56 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  26.52 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  27.07 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  26.52 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.97 
 
 		 176 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.92 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  26.67 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  28.64 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.88 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  30.3 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  32.53 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  28.42 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  23.76 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.32 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.64 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.16 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.27 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  25.15 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.92 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.43 
 
 		 184 aa  57  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1194  deaminase-reductase domain-containing protein  30.95 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5690  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.67 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.172276  normal  0.519116 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  25.27 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.06 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2481  bifunctional deaminase-reductase-like  26.9 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  26.55 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  23.76 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  25.27 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.89 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.37 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  30.53 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.73 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  28.57 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.59 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.22 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  26.24 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  26.7 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.37 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  26.42 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  24.23 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  26.56 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  26.15 
 
 		 178 aa  52.8  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.36 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.51 
 
 		 217 aa  52.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.26 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  25.77 
 
 		 178 aa  52  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  25 
 
 		 173 aa  51.6  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  30.23 
 
 		 183 aa  51.6  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  24.49 
 
 		 181 aa  51.6  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  27.81 
 
 		 180 aa  51.2  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  27.41 
 
 		 186 aa  51.2  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6219  deaminase-reductase domain-containing protein  28 
 
 		 221 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  30.06 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  26.46 
 
 		 177 aa  50.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.76 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  30.67 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  23.65 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  28.92 
 
 		 187 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  28.06 
 
 		 183 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3715  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.45 
 
 		 178 aa  49.3  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.48 
 
 		 173 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.48 
 
 		 178 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.15 
 
 		 180 aa  48.9  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  25.13 
 
 		 187 aa  48.9  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.78 
 
 		 187 aa  48.9  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>