91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4799 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4799  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  180  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.388253  normal  0.138579 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  86.54 
 
 
187 aa  95.9  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4932  deaminase-reductase domain-containing protein  86.54 
 
 
182 aa  95.9  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.916718  normal  0.605792 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  84.62 
 
 
187 aa  94.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  84.62 
 
 
187 aa  94.4  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  82.69 
 
 
187 aa  92.8  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  84.62 
 
 
187 aa  90.5  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  66.67 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  54.55 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  55.56 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  62.26 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  55.56 
 
 
188 aa  67.4  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  55.56 
 
 
188 aa  67.4  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  36.76 
 
 
177 aa  53.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  45.28 
 
 
185 aa  52  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2144  deaminase-reductase domain-containing protein  45.1 
 
 
180 aa  51.6  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.542593 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  44.44 
 
 
190 aa  51.2  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.53 
 
 
178 aa  50.8  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  52.08 
 
 
173 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46 
 
 
189 aa  50.4  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0286  bifunctional deaminase-reductase-like  43.14 
 
 
178 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1910  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  44.23 
 
 
199 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5103  putative deaminase-reductase  44.23 
 
 
177 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.81615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  43.14 
 
 
189 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  39.22 
 
 
183 aa  47.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.89 
 
 
188 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.59 
 
 
188 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.06 
 
 
187 aa  47  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  40.3 
 
 
193 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  45.28 
 
 
199 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3313  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.23 
 
 
181 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.15 
 
 
183 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3214  dihydrofolate reductase, putative  43.14 
 
 
57 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.633865  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  42.86 
 
 
180 aa  45.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.18 
 
 
185 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.14 
 
 
187 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4307  bifunctional deaminase-reductase-like  40.38 
 
 
167 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.912167  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.94 
 
 
184 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.46 
 
 
190 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  42.31 
 
 
188 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2397  dihydrofolate reductase  46 
 
 
116 aa  44.3  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.4 
 
 
188 aa  44.7  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.51 
 
 
177 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  41.18 
 
 
181 aa  43.9  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  32.35 
 
 
182 aa  43.9  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  40.38 
 
 
178 aa  43.5  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3644  hypothetical protein  46 
 
 
190 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.25 
 
 
176 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0339  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.91 
 
 
188 aa  42.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.183511 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0109  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  37.93 
 
 
191 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  32 
 
 
183 aa  43.5  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  38.1 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  40.74 
 
 
173 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  46.34 
 
 
174 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.62 
 
 
182 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  46.34 
 
 
173 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  35.19 
 
 
181 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4303  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.58 
 
 
208 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.933393  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  44 
 
 
196 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  40.38 
 
 
188 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4615  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.11 
 
 
193 aa  41.6  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.308446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.22 
 
 
188 aa  41.6  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.58 
 
 
188 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2707  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  44.23 
 
 
192 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  38.78 
 
 
183 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40 
 
 
192 aa  41.2  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  40.82 
 
 
183 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2481  bifunctional deaminase-reductase-like  33.96 
 
 
175 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.14 
 
 
197 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.33 
 
 
174 aa  40.8  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.67 
 
 
180 aa  40.8  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  40 
 
 
183 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  52.94 
 
 
193 aa  40.8  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.25 
 
 
185 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.9 
 
 
181 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.22 
 
 
183 aa  40.4  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  40 
 
 
183 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3987  bifunctional deaminase-reductase-like  44.44 
 
 
177 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3108  deaminase-reductase domain-containing protein  34 
 
 
207 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0380037  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  43.9 
 
 
173 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  43.9 
 
 
173 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  43.9 
 
 
173 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.19 
 
 
199 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.8 
 
 
182 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.18 
 
 
187 aa  40.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  43.9 
 
 
173 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.96 
 
 
194 aa  40.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  40.74 
 
 
187 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5690  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.3 
 
 
179 aa  40  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.172276  normal  0.519116 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  43.9 
 
 
173 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.85 
 
 
189 aa  40  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>