123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1728 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1728  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
192 aa  387  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2274  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  77.49 
 
 
192 aa  308  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2661  bifunctional deaminase-reductase domain protein  66.32 
 
 
192 aa  232  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.277256  normal  0.275954 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1772  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.27 
 
 
209 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187954 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3841  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.57 
 
 
196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.760815  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.12 
 
 
185 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.15 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.33 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.33 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.48 
 
 
201 aa  68.2  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.07 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.95 
 
 
187 aa  67.4  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  28.18 
 
 
183 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.05 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  28.18 
 
 
181 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  32.79 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  30.99 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.73 
 
 
192 aa  65.1  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.94 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.63 
 
 
201 aa  64.7  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.34 
 
 
181 aa  63.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.17 
 
 
189 aa  64.3  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  32.24 
 
 
208 aa  62  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.42 
 
 
189 aa  62  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  27.87 
 
 
185 aa  60.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4303  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.79 
 
 
208 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.933393  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0181  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.16 
 
 
204 aa  60.5  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.41 
 
 
185 aa  59.7  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.14 
 
 
203 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.42 
 
 
188 aa  58.9  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.69 
 
 
190 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  30.41 
 
 
196 aa  58.2  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.38 
 
 
221 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.62 
 
 
188 aa  57.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.58 
 
 
204 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.42 
 
 
180 aa  57  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  29.57 
 
 
183 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.87 
 
 
200 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  36.36 
 
 
187 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  26.92 
 
 
181 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.73 
 
 
187 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.37 
 
 
204 aa  55.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.84 
 
 
221 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.26 
 
 
183 aa  55.1  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.07 
 
 
210 aa  55.1  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.13 
 
 
183 aa  54.7  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  33.59 
 
 
221 aa  54.7  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28 
 
 
186 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.12 
 
 
208 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.63 
 
 
202 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.05 
 
 
178 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.37 
 
 
178 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7653  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.49 
 
 
187 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.61 
 
 
187 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2707  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.05 
 
 
192 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  26.29 
 
 
177 aa  52  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  31.58 
 
 
183 aa  52  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.27 
 
 
224 aa  51.6  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  36.79 
 
 
199 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30 
 
 
209 aa  51.6  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  31.78 
 
 
183 aa  51.2  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5956  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.31 
 
 
188 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.34 
 
 
187 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  25.14 
 
 
178 aa  50.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  24.86 
 
 
178 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.96 
 
 
221 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2883  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.86 
 
 
188 aa  49.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  36.45 
 
 
188 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  30.11 
 
 
187 aa  49.3  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  36.45 
 
 
188 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  36.45 
 
 
188 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  29.44 
 
 
179 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0902  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.71 
 
 
199 aa  49.3  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4932  deaminase-reductase domain-containing protein  37.62 
 
 
182 aa  48.9  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.916718  normal  0.605792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4631  deaminase-reductase domain-containing protein  28.12 
 
 
192 aa  48.9  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  25.87 
 
 
181 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.85 
 
 
212 aa  48.5  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.78 
 
 
186 aa  48.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.21 
 
 
187 aa  48.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.19 
 
 
189 aa  47.8  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.28 
 
 
190 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.26 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.5 
 
 
190 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253763  normal  0.175179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5564  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.32 
 
 
188 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  29.17 
 
 
199 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  27.81 
 
 
196 aa  47  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.65 
 
 
184 aa  46.6  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.65 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5654  hypothetical protein  34.52 
 
 
122 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316423  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6219  deaminase-reductase domain-containing protein  40 
 
 
221 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.82 
 
 
181 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  27.36 
 
 
215 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  27.01 
 
 
204 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.72 
 
 
183 aa  45.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25 
 
 
188 aa  45.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  23.66 
 
 
188 aa  45.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3142  deaminase-reductase domain-containing protein  27.91 
 
 
192 aa  45.4  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.921485 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  35.96 
 
 
193 aa  45.1  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.51 
 
 
217 aa  43.9  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  23.16 
 
 
219 aa  43.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>