More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0706 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0706  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 330 aa  682    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0374737  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0626  AraC family transcriptional regulator  87.58 
 
 		 330 aa  607  1e-173  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.653952  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1770  transcriptional regulator, AraC family  29.77 
 
 		 320 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0328  transcriptional regulator, AraC family  26.47 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0920  AraC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0175793  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  28.93 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0895  AraC family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1432  transcriptional regulator, AraC family  25.26 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185359  normal  0.618503 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  31.53 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1670  transcriptional regulator, AraC family  27.04 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4205  AraC family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 382 aa  67  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.382392 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3739  helix-turn-helix domain-containing protein  26.88 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.975676  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0304  transcriptional regulator, AraC family  32.12 
 
 		 336 aa  65.9  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0308  transcriptional regulator, AraC family  33.64 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162295  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2606  transcriptional regulator, AraC family  25.45 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177671  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  25.16 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2634  DNA-binding transcriptional regulator AraC  32.29 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3125  transcriptional regulator, AraC family  27.98 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000947593  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3035  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.2 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0234  transcription regulator protein  29.1 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0681  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3800  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000600898 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3954  helix-turn-helix domain-containing protein  42.17 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2358  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.738853  normal  0.890173 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0671  AraC family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29140  response regulator containing CheY-like receiver domain and AraC-type DNA-binding domain  29.46 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5288  AraC family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0305089  normal  0.89359 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3368  AraC family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4999  AraC family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0916348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0361  AraC family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 245 aa  62.4  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1482  transcriptional regulator, AraC family  23.17 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  31.13 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1197  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 335 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00505676  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22580  AraC family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 254 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000567306  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1639  AraC family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.066752 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2287  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000984991  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.33 
 
 		 156 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  42.03 
 
 		 773 aa  61.6  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  25.22 
 
 		 160 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1906  putative transcriptional regulator  32.26 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3808  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2748  AraC family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195621  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06729  hypothetical protein  23.03 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  30.06 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1474  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000822  transcriptional regulator AraC family  27.97 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.184938  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1106  AraC family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2577  transcriptional regulator, AraC family  23.61 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.996426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2397  two component transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  32.63 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3197  DNA-binding transcriptional regulator AraC  28.3 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0504834 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0773  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0083  transcriptional regulator, AraC family  26.95 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7173  two component AraC family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6071  two component AraC family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1711  transcriptional regulator, AraC family  36.71 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0219  helix-turn-helix domain-containing protein  28.76 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.882333  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0074  AraC-type DNA-binding protein, response regulator  31.75 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0079  transcriptional regulator, AraC family  36.47 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0934  AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 365 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0841  AraC family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2399  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1122  AraC family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00477  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  38.55 
 
 		 211 aa  58.9  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1107  AraC family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4422  transcriptional regulator, AraC family  28.06 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465856  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1394  two component AraC family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 523 aa  59.3  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042226  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  32.08 
 
 		 530 aa  58.9  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1299  transcriptional regulator, AraC family  27.09 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  28.3 
 
 		 162 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3315  AraC family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.024617  hitchhiker  0.00000399067 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4119  AraC family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22320  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  38.46 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000320877  normal  0.335599 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  36.36 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0210  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0525  two component AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 522 aa  58.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4424  transcriptional regulator, AraC family  25.98 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.353998  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1220  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.21436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5702  transcriptional regulator, AraC family  23.53 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.946416 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3316  helix-turn-helix domain-containing protein  26.67 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606896  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0074  transcriptional regulator, AraC family protein  32 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6368  two component AraC family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2339  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.295664 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2638  transcriptional regulator, AraC family  31.13 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3657  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  28.87 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  31.65 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6198  two component AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5929  two component AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5912  AraC family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1400  helix-turn-helix domain-containing protein  32.61 
 
 		 255 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113749  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  29.34 
 
 		 291 aa  57  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5952  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 142 aa  57  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4910  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.45379  normal  0.327083 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3765  AraC family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 385 aa  57  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0713818  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>