More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0304 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0304  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 336 aa  683    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1770  transcriptional regulator, AraC family  35.83 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0308  transcriptional regulator, AraC family  35.4 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0328  transcriptional regulator, AraC family  31.54 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1432  transcriptional regulator, AraC family  26.73 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185359  normal  0.618503 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0920  AraC family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 313 aa  90.1  5e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0175793  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2126  transcriptional regulator, AraC family  26.11 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000362922  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0706  transcriptional regulator, AraC family  32.12 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0374737  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4346  transcriptional regulator, AraC family  28.76 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.0157196 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0626  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.653952  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 329 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2914  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2680  transcriptional regulator, AraC family  28.97 
 
 		 329 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1107  AraC family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1122  AraC family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1482  transcriptional regulator, AraC family  27.75 
 
 		 345 aa  65.9  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3772  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  35.35 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3751  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  33.67 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000128468 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3788  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  33.67 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0895  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  25.63 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2415  transcriptional regulator, AraC family  26.07 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125553 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2581  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0247972  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0079  transcriptional regulator, AraC family  31.61 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0879  AraC family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3585  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  32.65 
 
 		 198 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3485  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 198 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.781082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3497  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 198 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.27794  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3869  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  32.65 
 
 		 198 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5279  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 285 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4205  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.382392 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0589  AraC family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.564804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2150  transcriptional regulator, AraC family  27.67 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28417  normal  0.200659 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1197  transcriptional regulator, AraC family  23.53 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00505676  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  24.62 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  30.28 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3359  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  26.73 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5008  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.896385 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1459  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  32.65 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000164097 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1473  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  22.27 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.844163  normal  0.308396 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1123  AraC family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408169  normal  0.947213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  26.96 
 
 		 537 aa  59.7  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  26.62 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  32.79 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1805  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3508  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0210792  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3316  helix-turn-helix domain-containing protein  29.17 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606896  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3840  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  31.63 
 
 		 198 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2321  transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.612609 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  31.69 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0666  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00660506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  31.69 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1106  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2365  transcriptional regulator, AraC family  34.11 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0941  helix-turn-helix domain-containing protein  24.38 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3203  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10279  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6795  transcriptional regulator, AraC family  28.42 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312804  hitchhiker  0.00000309577 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 156 aa  57  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3634  AraC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5347  transcriptional regulator, AraC family  27.14 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.93449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  29.5 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 316 aa  57  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001047  transcriptional regulator AraC family  34.74 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3164  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0245945  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1497  helix-turn-helix domain-containing protein  25.63 
 
 		 333 aa  57  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.956503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1001  transcriptional regulator, AraC family  21.22 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2225  AraC family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120601  normal  0.705003 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1904  transcriptional regulator, AraC family  37.89 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1575  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.27 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000250184  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2328  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241475  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0314  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03650  transcriptional regulator  25.14 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0787  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0185188  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4270  helix-turn-helix domain-containing protein  20.2 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3282  helix-turn-helix domain-containing protein  34.15 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  30.95 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4589  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  31.97 
 
 		 301 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1619  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.75 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0667714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1585  AraC family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 350 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4364  transcriptional regulator, AraC family  28.28 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196876  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0430  transcriptional regulator, AraC family  26.03 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  29.31 
 
 		 330 aa  55.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  32.76 
 
 		 1366 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 291 aa  55.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>