More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1104 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1104  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 338 aa  653    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2287  RND family efflux transporter MFP subunit  65.27 
 
 		 332 aa  403  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4697  RND family efflux transporter MFP subunit  46.35 
 
 		 319 aa  248  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.715091  normal  0.20048 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3222  secretion protein HlyD  43.5 
 
 		 328 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.509299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4301  secretion protein HlyD  44.12 
 
 		 335 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1393  RND family efflux transporter MFP subunit  46.44 
 
 		 336 aa  227  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.283245  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0242  RND family efflux transporter MFP subunit  47.57 
 
 		 322 aa  226  6e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4200  secretion protein HlyD  42.77 
 
 		 333 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3720  RND family efflux pump membrane fusion protein  43.66 
 
 		 333 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0718738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.95 
 
 		 331 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0461  multidrug/cation efflux pump  44.63 
 
 		 317 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2114  RND family efflux transporter MFP subunit  44.63 
 
 		 317 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2383  RND family efflux transporter MFP subunit  45.33 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2474  RND family efflux transporter MFP subunit  36.68 
 
 		 344 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.913937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3724  RND family efflux transporter MFP subunit  36.62 
 
 		 357 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.469854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3238  RND family efflux transporter MFP subunit  32.92 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4556  RND family efflux transporter MFP subunit  31.18 
 
 		 383 aa  75.5  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589535  normal  0.76991 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3424  secretion protein HlyD  31.15 
 
 		 412 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0212  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 364 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1596  RND family efflux transporter MFP subunit  31.38 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.566633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.89 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000851177  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5678  RND multidrug efflux membrane permease  28.57 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116092  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2684  multidrug efflux system subunit MdtA  29.08 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0942  acriflavine resistance protein E  30.05 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.2 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0123174  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3799  RND family efflux transporter MFP subunit  32.14 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.43 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0916  efflux transporter  30.15 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14330  Secretion protein HlyD family  29.51 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774042  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01979  multidrug efflux system, subunit A  28.93 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01971  hypothetical protein  28.93 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.41 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0736  RND family efflux transporter MFP subunit  25.16 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0715  RND family efflux transporter MFP subunit  31.55 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4122  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.92 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  26.23 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0766  HlyD family secretion protein  25.77 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3581  secretion protein HlyD  29.22 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2757  secretion protein HlyD  25.08 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.336362 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1159  multidrug efflux system subunit MdtA  28.43 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3014  multidrug efflux system subunit MdtA  28.43 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.105913 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.52 
 
 		 430 aa  62.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0816  HlyD family secretion protein  30.92 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0986  multidrug efflux system subunit MdtA  28.93 
 
 		 415 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6002  RND family efflux transporter MFP subunit  31.76 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249457  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3604  secretion protein HlyD  29.47 
 
 		 422 aa  62.8  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105186  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2802  RND family efflux transporter MFP subunit  29.26 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.662741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1567  multidrug efflux system subunit MdtA  28.43 
 
 		 455 aa  62  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.331208 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2366  multidrug efflux system subunit MdtA  28.43 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.43 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117238  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2644  RND family efflux transporter MFP subunit  31.07 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1706  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.52 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2803  secretion protein HlyD  27.33 
 
 		 376 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.602838  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2216  multidrug efflux system subunit MdtA  28.43 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02664  putative multidrug resistance protein (substrate binding lipoprotein)  30.9 
 
 		 359 aa  62  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0150101  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.46 
 
 		 455 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416467  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2902  secretion protein HlyD  30.22 
 
 		 464 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.56576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0450  RND family efflux transporter MFP subunit  27.59 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.825026 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2497  secretion protein HlyD  27.7 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0156219  normal  0.535826 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2363  multidrug efflux system subunit MdtA  28.06 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.67985 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2558  secretion protein HlyD  29.12 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2569  secretion protein HlyD  29.44 
 
 		 462 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.103631 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.51 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3365  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496799  normal  0.0176512 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2472  multidrug efflux system subunit MdtA  27.69 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.957345 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1651  secretion protein HlyD  27.7 
 
 		 407 aa  59.7  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.986785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  30.21 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2329  RND family efflux transporter MFP subunit  28.26 
 
 		 436 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.4455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1788  RND family efflux transporter MFP subunit  32 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  26.62 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0695  hypothetical protein  25.29 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2639  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.48 
 
 		 436 aa  59.3  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2256  multidrug efflux system subunit MdtA  27.69 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1523  secretion protein HlyD  29.67 
 
 		 457 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.116484 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2312  multidrug efflux system subunit MdtA  27.69 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2136  putative transporter lipoprotein transmembrane  29.55 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2431  RND family efflux transporter MFP subunit  28.4 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638771  normal  0.904192 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2356  multidrug efflux system subunit MdtA  27.69 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  25.46 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.57 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1610  RND family efflux transporter MFP subunit  26.82 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.665479  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4053  RND family efflux transporter MFP subunit  28.9 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.71 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1989  RND family efflux transporter MFP subunit  25.62 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2186  RND family efflux transporter MFP subunit  28.26 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3585  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.26 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2753  HlyD family secretion protein  25.87 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0713  hypothetical protein  23.98 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3552  multidrug efflux system subunit MdtA  28.5 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.36 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3107  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30 
 
 		 392 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.32243 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2434  RND family efflux transporter MFP subunit  31.15 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.671436  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28820  secretion protein, HlyD family  32.04 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0913  hypothetical protein  26.19 
 
 		 338 aa  57  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2827  RND family efflux transporter MFP subunit  27.93 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00918161  hitchhiker  0.00100699 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4148  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.63 
 
 		 560 aa  57  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3852  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.91 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2966  multidrug efflux system subunit MdtA  30 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.874422  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0035  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.38 
 
 		 404 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3628  secretion protein HlyD  28.5 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>