64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0599 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0599  conjugal transfer protein TrbJ  100 
 
 		 244 aa  481  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3996  conjugal transfer protein TrbJ  88.52 
 
 		 244 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1190  conjugal transfer protein TrbJ  64.34 
 
 		 259 aa  279  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3545  conjugal transfer protein TrbJ  64.34 
 
 		 259 aa  279  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2882  conjugal transfer protein TrbJ  65.46 
 
 		 253 aa  278  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0488522  normal  0.0400319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7745  conjugal transfer protein TrbJ  67.11 
 
 		 254 aa  278  8e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662421 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0505  conjugal transfer protein TrbJ  66.27 
 
 		 253 aa  278  8e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00617649  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0745  conjugal transfer protein TrbJ  64.66 
 
 		 253 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2320  conjugal transfer protein TrbJ  63.67 
 
 		 253 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570839  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3897  conjugal transfer protein TrbJ  60.74 
 
 		 245 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.227906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3216  conjugal transfer protein TrbJ  66.2 
 
 		 260 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.377133  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1480  conjugal transfer protein TrbJ  59.68 
 
 		 260 aa  260  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3090  conjugal transfer protein TrbJ  66.94 
 
 		 253 aa  260  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3000  conjugal transfer protein TrbJ  66.67 
 
 		 252 aa  256  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0695  conjugal transfer protein TrbJ  64.52 
 
 		 254 aa  253  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3855  conjugal transfer protein TrbJ  60.59 
 
 		 253 aa  246  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00466031  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1504  conjugal transfer protein TrbJ  62.18 
 
 		 244 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3368  conjugal transfer protein TrbJ  61.64 
 
 		 245 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3831  conjugal transfer protein TrbJ  64.14 
 
 		 256 aa  241  7e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0323585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3537  conjugal transfer protein TrbJ  61.54 
 
 		 245 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3198  conjugal transfer protein TrbJ  53.91 
 
 		 265 aa  228  6e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0152  conjugal transfer protein TrbJ  56.48 
 
 		 266 aa  223  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2828  conjugal transfer protein TrbJ  52.14 
 
 		 245 aa  215  4e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2272  conjugal transfer protein TrbJ  61.93 
 
 		 243 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0165  conjugal transfer protein TrbJ  55.25 
 
 		 244 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440181  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2096  conjugal transfer protein TrbJ  48.2 
 
 		 249 aa  205  6e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0962  conjugal transfer protein TrbJ  51.53 
 
 		 244 aa  197  9e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7444  conjugal transfer protein TrbJ  50.81 
 
 		 248 aa  192  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1009  conjugal transfer protein TrbJ  46.53 
 
 		 248 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2610  conjugal transfer protein TrbJ  56.42 
 
 		 240 aa  185  6e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3695  conjugal transfer protein TrbJ  56.28 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2482  conjugal transfer protein TrbJ  51.18 
 
 		 239 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0314  conjugal transfer protein TrbJ  49.58 
 
 		 258 aa  168  7e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2907  conjugal transfer protein TrbJ  43.81 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.450619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3502  conjugal transfer protein TrbJ  42.62 
 
 		 251 aa  159  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1144  conjugal transfer protein TrbJ  46.12 
 
 		 243 aa  159  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2649  conjugal transfer protein TrbJ  42.62 
 
 		 251 aa  158  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1554  conjugal transfer protein TrbJ  43.91 
 
 		 241 aa  158  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0730  conjugal transfer protein TrbJ  44.44 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2695  conjugal transfer protein TrbJ  42.62 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1320  conjugal transfer protein TrbJ  44.5 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35680  conjugal transfer protein TrbJ  43.11 
 
 		 245 aa  154  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2580  conjugal transfer protein TrbJ  40.66 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1286  conjugal transfer protein TrbJ  40.57 
 
 		 247 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2354  conjugal transfer protein TrbJ  39.34 
 
 		 242 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00542986  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0434  conjugal transfer protein TrbJ  44.81 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2008  conjugal transfer protein TrbJ  40.97 
 
 		 245 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.589557  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1839  conjugal transfer protein TrbJ  38.3 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.835985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1899  conjugal transfer protein TrbJ  42.74 
 
 		 241 aa  139  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.668974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30900  conjugal transfer protein TrbJ  42.74 
 
 		 241 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000007788  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4199  conjugal transfer protein TrbJ  39.91 
 
 		 242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.72742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3702  conjugal transfer protein TrbJ  42.8 
 
 		 241 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1345  conjugal transfer protein TrbJ  43.05 
 
 		 245 aa  131  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2031  conjugal transfer protein TrbJ  43.27 
 
 		 242 aa  128  8.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.390142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2350  P-type conjugative transfer protein TrbJ  26.29 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1616  P-type conjugative transfer protein TrbJ  33.33 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9655  conjugal transfer protein TrbJ  26.79 
 
 		 262 aa  50.1  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279512  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4749  hypothetical protein  35.21 
 
 		 257 aa  48.9  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695335  normal  0.293585 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5219  putative conjugal transfer protein TrbJ  31.49 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2347  P-type conjugative transfer protein TrbJ  24.59 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5486  conjugal transfer protein TrbJ  25.75 
 
 		 266 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0871579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5610  hypothetical protein  38.75 
 
 		 320 aa  45.8  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9263  conjugal transfer protein TrbJ  24.18 
 
 		 269 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5371  P-type conjugative transfer protein TrbJ  34.38 
 
 		 240 aa  43.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15162  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>