124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03680 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  85.18 
 
 		 1301 aa  2248    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  61.94 
 
 		 1291 aa  1620    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  100 
 
 		 1266 aa  2585    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  49.64 
 
 		 1287 aa  1276    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  29.1 
 
 		 1276 aa  549  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  28.94 
 
 		 1291 aa  549  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  28.68 
 
 		 1276 aa  547  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  27.72 
 
 		 1305 aa  535  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  27.61 
 
 		 1307 aa  534  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  27.61 
 
 		 1307 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  28.97 
 
 		 1277 aa  531  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  28.89 
 
 		 1266 aa  515  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  28.73 
 
 		 1266 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1266 aa  512  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  27.86 
 
 		 1284 aa  509  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1266 aa  512  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1266 aa  512  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  27.65 
 
 		 1265 aa  504  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  27.62 
 
 		 1266 aa  503  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  27.62 
 
 		 1266 aa  501  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  27.62 
 
 		 1266 aa  499  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  27.54 
 
 		 1266 aa  499  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  27.62 
 
 		 1266 aa  499  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1266 aa  495  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1266 aa  496  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  27.5 
 
 		 1266 aa  494  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  27.62 
 
 		 1266 aa  496  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1383 aa  474  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  26.19 
 
 		 1301 aa  464  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  26.91 
 
 		 1439 aa  466  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  26.74 
 
 		 1392 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1127  membrane protein-like protein  25.71 
 
 		 1294 aa  453  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334782  normal  0.712644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  26.82 
 
 		 1417 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  26.23 
 
 		 1419 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  26.2 
 
 		 1416 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1443 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  26.07 
 
 		 1436 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1390 aa  439  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1417 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00269  putative protease  25.9 
 
 		 1331 aa  432  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  25.58 
 
 		 1459 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1441 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  25.66 
 
 		 1454 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  25.5 
 
 		 1446 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  25.16 
 
 		 1323 aa  406  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3329  hypothetical protein  25 
 
 		 1419 aa  390  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0472  membrane protein  28.02 
 
 		 1515 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  24.14 
 
 		 1265 aa  263  1e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  21.59 
 
 		 1261 aa  231  7e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  21.99 
 
 		 1284 aa  227  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2235  hypothetical protein  23.97 
 
 		 1290 aa  226  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  20.94 
 
 		 1271 aa  224  8e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  20.59 
 
 		 1273 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  21.27 
 
 		 1273 aa  222  3e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  20.74 
 
 		 1267 aa  221  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  21.1 
 
 		 1273 aa  221  7e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  21.53 
 
 		 1277 aa  219  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  22.42 
 
 		 1304 aa  218  5.9999999999999996e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  22.81 
 
 		 1341 aa  217  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  22.32 
 
 		 1394 aa  215  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  20.16 
 
 		 1271 aa  214  7e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  23.34 
 
 		 1300 aa  214  7e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  22.22 
 
 		 1381 aa  211  7e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  21.66 
 
 		 1309 aa  208  5e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  21.87 
 
 		 1273 aa  207  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  21.28 
 
 		 1271 aa  207  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4656  hypothetical protein  22.72 
 
 		 1425 aa  206  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  20.81 
 
 		 1269 aa  201  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  22.65 
 
 		 1398 aa  201  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  20.51 
 
 		 1307 aa  201  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  20.39 
 
 		 1271 aa  199  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  22.73 
 
 		 1384 aa  198  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  23.63 
 
 		 1472 aa  196  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  20.28 
 
 		 1275 aa  194  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1505  membrane protein-like  24.32 
 
 		 1283 aa  194  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000453243  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  19.7 
 
 		 1276 aa  191  9e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  23.54 
 
 		 1379 aa  190  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  22.88 
 
 		 1426 aa  186  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  20.47 
 
 		 1288 aa  184  7e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  22.16 
 
 		 1419 aa  179  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  21.59 
 
 		 1397 aa  179  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  21.59 
 
 		 1397 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  21.84 
 
 		 1420 aa  176  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  21.52 
 
 		 1397 aa  174  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  21.54 
 
 		 1368 aa  173  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2216  hypothetical protein  21.54 
 
 		 1372 aa  172  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0519007  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1942  membrane protein-like protein  19.65 
 
 		 1272 aa  173  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.307785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  21.54 
 
 		 1397 aa  172  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  21.54 
 
 		 1397 aa  172  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  22.77 
 
 		 1378 aa  172  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  22.25 
 
 		 1426 aa  172  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  22.02 
 
 		 1426 aa  169  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  21.8 
 
 		 1384 aa  169  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3970  hypothetical protein  21.86 
 
 		 1430 aa  168  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231617 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  22.18 
 
 		 1346 aa  167  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  21.41 
 
 		 1397 aa  167  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1493  membrane protein-like protein  23.4 
 
 		 1379 aa  162  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  20.22 
 
 		 1264 aa  158  6e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  19.9 
 
 		 1441 aa  158  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  22.24 
 
 		 1286 aa  153  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>