More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0897 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  324  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  70.44 
 
 		 158 aa  233  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  68.79 
 
 		 167 aa  222  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  60 
 
 		 174 aa  199  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  56.13 
 
 		 165 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  56.13 
 
 		 158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  56.13 
 
 		 165 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  52.9 
 
 		 157 aa  173  7e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  52.23 
 
 		 158 aa  173  8e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  62.41 
 
 		 142 aa  173  9e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  52.26 
 
 		 161 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  52.26 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  52.26 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  52.26 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  52.26 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  52.26 
 
 		 157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  52.26 
 
 		 158 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  50.97 
 
 		 160 aa  169  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 181 aa  167  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  50.32 
 
 		 160 aa  167  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  50.31 
 
 		 158 aa  166  9e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  61.03 
 
 		 135 aa  165  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1337  MarR family transcriptional regulator  50.97 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  53.29 
 
 		 173 aa  161  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  48.75 
 
 		 161 aa  157  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1188  MarR family transcriptional regulator  51.57 
 
 		 167 aa  156  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  50 
 
 		 191 aa  152  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  51.01 
 
 		 162 aa  151  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4007  MarR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 148 aa  140  9e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177253  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 167 aa  128  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  43.45 
 
 		 187 aa  110  8.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  36.73 
 
 		 162 aa  107  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 182 aa  102  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  34.59 
 
 		 177 aa  87.8  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  36.97 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  36.97 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  32.76 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  31.08 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34950  MarR family regulatory protein  30.83 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  28.38 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2954  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0252271 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  38.3 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  32.41 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  40.59 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  35.64 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  25 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  42.67 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  33.61 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1910  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578168  normal  0.331204 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 135 aa  57  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  40.71 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  34.95 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>