More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0350 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0350  toxin co-regulated pilus biosynthesis protein I  100 
 
 		 620 aa  1256    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.45 
 
 		 619 aa  258  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1434  methyl-accepting chemotaxis protein  37.43 
 
 		 543 aa  213  7e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.44 
 
 		 543 aa  206  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.75882  hitchhiker  0.00000661881 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0170  methyl-accepting chemotaxis protein  38.57 
 
 		 543 aa  202  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05097  sensor protein TorS  36.16 
 
 		 542 aa  186  9e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02986  hypothetical protein  40.85 
 
 		 377 aa  185  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0265  methyl-accepting chemotaxis protein  35.82 
 
 		 561 aa  183  7e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0070  methyl-accepting chemotaxis protein  35.71 
 
 		 547 aa  183  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.740118  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1636  methyl-accepting chemotaxis protein  34.34 
 
 		 547 aa  179  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001231  methyl-accepting chemotaxis protein  35.57 
 
 		 542 aa  174  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.554422  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001261  methyl-accepting chemotaxis protein  34.01 
 
 		 547 aa  173  9e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05136  torS; sensor protein TorS  33.05 
 
 		 558 aa  171  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0950  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.37 
 
 		 667 aa  162  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.231949  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004004  methyl-accepting chemotaxis protein  34.16 
 
 		 663 aa  160  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2528  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.99 
 
 		 665 aa  160  9e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0946  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.24 
 
 		 667 aa  159  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0948  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.24 
 
 		 667 aa  158  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.05 
 
 		 667 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.869835 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01518  hypothetical protein  34.91 
 
 		 674 aa  157  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.54 
 
 		 630 aa  157  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.42 
 
 		 630 aa  157  8e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.54 
 
 		 630 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.35 
 
 		 637 aa  155  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.54 
 
 		 630 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2502  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.25 
 
 		 649 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.988754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3428  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.83 
 
 		 667 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3553  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.83 
 
 		 667 aa  154  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0712  methyl-accepting chemotaxis citrate transducer  32.66 
 
 		 546 aa  154  5.9999999999999996e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3356  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.54 
 
 		 667 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.386472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0934  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.72 
 
 		 667 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1498  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.95 
 
 		 687 aa  153  8e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000111484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0767  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.09 
 
 		 546 aa  152  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.77 
 
 		 568 aa  153  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1488  methyl-accepting chemotaxis protein  33.71 
 
 		 672 aa  152  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.619219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3424  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.44 
 
 		 674 aa  152  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.560716  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.32 
 
 		 630 aa  151  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.55 
 
 		 630 aa  151  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2678  methyl-accepting chemotaxis protein  28.21 
 
 		 533 aa  150  5e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221197  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2315  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  31.76 
 
 		 653 aa  150  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.967368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1353  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.57 
 
 		 547 aa  150  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.769572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.59 
 
 		 638 aa  150  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.14 
 
 		 631 aa  150  8e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.14 
 
 		 630 aa  150  8e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397129 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2511  methyl-accepting chemotaxis protein  31.7 
 
 		 653 aa  150  9e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295069  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0771  methyl-accepting chemotaxis protein  34.82 
 
 		 661 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1324  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  31.81 
 
 		 523 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  29.29 
 
 		 630 aa  148  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03417  methyl-accepting chemotaxis protein  33.43 
 
 		 674 aa  148  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617562  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  28.6 
 
 		 559 aa  147  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.25 
 
 		 564 aa  147  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.92 
 
 		 716 aa  147  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.23 
 
 		 630 aa  147  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2526  methyl-accepting chemotaxis protein  31.42 
 
 		 559 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.591236  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3605  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.59 
 
 		 666 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.644417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  26.67 
 
 		 639 aa  147  8.000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.04 
 
 		 773 aa  146  9e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.79 
 
 		 638 aa  146  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  34.55 
 
 		 647 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1176  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.71 
 
 		 495 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00652986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.71 
 
 		 495 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0413666  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.71 
 
 		 495 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000101058  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3213  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.71 
 
 		 495 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.023485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  26.5 
 
 		 639 aa  145  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0365  accessory colonization factor AcfB  28.95 
 
 		 626 aa  145  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  30.23 
 
 		 712 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  30.23 
 
 		 712 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  27.81 
 
 		 623 aa  144  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0671  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.49 
 
 		 531 aa  145  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178659  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1023  methyl-accepting chemotaxis protein  33.02 
 
 		 578 aa  144  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.2 
 
 		 541 aa  144  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31400  putative chemotaxis transducer  32.75 
 
 		 575 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.307711  hitchhiker  0.0000000000413464 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.38 
 
 		 622 aa  144  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.493821  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.93 
 
 		 554 aa  144  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2783  methyl-accepting chemotaxisprotein  32.2 
 
 		 690 aa  144  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.468562 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4266  chemotaxis sensory transducer  30.14 
 
 		 546 aa  144  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2672  putative chemotaxis transducer  33.52 
 
 		 538 aa  143  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.119833  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0911  chemotaxis sensory transducer  32.39 
 
 		 705 aa  143  9e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000403524  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.67 
 
 		 638 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004525  methyl-accepting chemotaxis protein  36.06 
 
 		 418 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  31.48 
 
 		 713 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.61 
 
 		 653 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297466 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.02 
 
 		 638 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0712  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.04 
 
 		 624 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.77 
 
 		 674 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3237  methyl-accepting chemotaxis protein  31.82 
 
 		 771 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.64 
 
 		 638 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.02 
 
 		 638 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.47 
 
 		 632 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.57 
 
 		 647 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.75 
 
 		 541 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02418  hypothetical protein  29.09 
 
 		 578 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26280  putative chemotaxis transducer  31.53 
 
 		 545 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.917899 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.22 
 
 		 545 aa  141  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.888266  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.67 
 
 		 622 aa  142  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  28.84 
 
 		 640 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1016  methyl-accepting chemotaxis protein  29.08 
 
 		 563 aa  142  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3534  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  27.4 
 
 		 629 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.667463  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.3 
 
 		 499 aa  141  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0811848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1012  hypothetical protein  27.64 
 
 		 626 aa  141  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>