More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0070 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001261  methyl-accepting chemotaxis protein  61.97 
 
 
547 aa  636    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05136  torS; sensor protein TorS  63.62 
 
 
558 aa  655    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0070  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
547 aa  1092    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.740118  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0265  methyl-accepting chemotaxis protein  49.82 
 
 
561 aa  480  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05097  sensor protein TorS  47.9 
 
 
542 aa  465  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001231  methyl-accepting chemotaxis protein  47.71 
 
 
542 aa  456  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.554422  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0712  methyl-accepting chemotaxis citrate transducer  46.07 
 
 
546 aa  436  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1434  methyl-accepting chemotaxis protein  41.5 
 
 
543 aa  263  6e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.28 
 
 
543 aa  254  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.75882  hitchhiker  0.00000661881 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0771  methyl-accepting chemotaxis protein  37.18 
 
 
661 aa  237  5.0000000000000005e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.15 
 
 
637 aa  217  5e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.88 
 
 
642 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.62 
 
 
638 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  37.2 
 
 
541 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.88 
 
 
716 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  32.92 
 
 
541 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1636  methyl-accepting chemotaxis protein  37.96 
 
 
547 aa  212  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  39.17 
 
 
642 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0170  methyl-accepting chemotaxis protein  41.14 
 
 
543 aa  210  5e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3114  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.43 
 
 
541 aa  210  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.860602  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.15 
 
 
543 aa  209  8e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  35.39 
 
 
713 aa  208  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.99 
 
 
674 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.96 
 
 
572 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2907  chemotaxis sensory transducer  40.82 
 
 
541 aa  206  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  39.19 
 
 
712 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.5 
 
 
739 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247309  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2643  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.56 
 
 
550 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0855376  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.68 
 
 
647 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0828859  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4528  methyl-accepting chemotaxis protein  37.96 
 
 
672 aa  205  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4706  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.38 
 
 
541 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  39.19 
 
 
712 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.48 
 
 
647 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.31 
 
 
541 aa  203  8e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.608007  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.09 
 
 
681 aa  202  9e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.36 
 
 
637 aa  202  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4833  chemotaxis sensory transducer  38.72 
 
 
541 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000956827  normal  0.082646 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.61 
 
 
636 aa  201  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43220  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  35.38 
 
 
652 aa  200  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3680  methyl-accepting chemotaxis protein  36.47 
 
 
676 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0580  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.33 
 
 
679 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.42 
 
 
541 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  decreased coverage  0.0000342214 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.57 
 
 
541 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.42 
 
 
541 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.722367  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3279  methyl-accepting chemotaxis protein  36.48 
 
 
541 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149652  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.28 
 
 
544 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  34.59 
 
 
633 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0897  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.14 
 
 
541 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4624  methyl-accepting chemotaxis protein  38.11 
 
 
539 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1491  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.11 
 
 
539 aa  198  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3441  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.14 
 
 
541 aa  198  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.53 
 
 
640 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0106  methyl-accepting chemotaxis protein  38.57 
 
 
546 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.827543  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.52 
 
 
650 aa  197  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.35 
 
 
541 aa  196  8.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43710  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  38.66 
 
 
541 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.4 
 
 
541 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.452969  normal  0.355365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3666  chemotaxis transducer  36.78 
 
 
541 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.260935  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0340  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.82 
 
 
541 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.582352  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.76 
 
 
632 aa  195  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.96 
 
 
653 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297466 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.84 
 
 
619 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3424  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.83 
 
 
674 aa  194  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.560716  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.75 
 
 
499 aa  194  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0811848  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.28 
 
 
541 aa  193  7e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.476721 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.75 
 
 
425 aa  193  8e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.817651  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.47 
 
 
541 aa  193  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799555  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.84 
 
 
558 aa  192  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 
638 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.29 
 
 
638 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.71 
 
 
522 aa  192  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.34 
 
 
673 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.73728 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.34 
 
 
673 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1210  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.28 
 
 
540 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.289047 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.4 
 
 
674 aa  192  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.99 
 
 
714 aa  192  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0164438 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4266  chemotaxis sensory transducer  37.6 
 
 
546 aa  192  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261421  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.2 
 
 
638 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2634  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.96 
 
 
542 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.917034  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3212  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.34 
 
 
673 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.990285  normal  0.659639 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.69 
 
 
539 aa  191  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.910778 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0732  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.95 
 
 
555 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0444  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.57 
 
 
647 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414929  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0350  toxin co-regulated pilus biosynthesis protein I  35.33 
 
 
620 aa  191  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0931  methyl-accepting chemotaxis protein  37.07 
 
 
543 aa  191  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31400  putative chemotaxis transducer  38.29 
 
 
575 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.307711  hitchhiker  0.0000000000413464 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.63 
 
 
572 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2822  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.09 
 
 
673 aa  190  7e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.27 
 
 
638 aa  190  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2593  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36 
 
 
540 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.591477 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.2 
 
 
539 aa  189  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.73 
 
 
640 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0157  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.01 
 
 
646 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.805637  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  38.11 
 
 
647 aa  189  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.89 
 
 
638 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0868  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  32.63 
 
 
546 aa  188  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3351  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.21 
 
 
570 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540062  normal  0.0241334 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1124  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.86 
 
 
547 aa  187  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00163985  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0671  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.61 
 
 
531 aa  187  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178659  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4141  chemotaxis transducer  39.01 
 
 
541 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>