More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1434 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1434  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
543 aa  1085    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86 
 
 
543 aa  897    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.75882  hitchhiker  0.00000661881 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2773  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.48 
 
 
540 aa  305  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0170  methyl-accepting chemotaxis protein  45.58 
 
 
543 aa  275  2.0000000000000002e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05097  sensor protein TorS  36.57 
 
 
542 aa  257  5e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001231  methyl-accepting chemotaxis protein  38.61 
 
 
542 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.554422  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0070  methyl-accepting chemotaxis protein  41.5 
 
 
547 aa  254  3e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.740118  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0265  methyl-accepting chemotaxis protein  41.97 
 
 
561 aa  254  4.0000000000000004e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001261  methyl-accepting chemotaxis protein  41.14 
 
 
547 aa  246  8e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05136  torS; sensor protein TorS  40.69 
 
 
558 aa  245  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0712  methyl-accepting chemotaxis citrate transducer  42.06 
 
 
546 aa  241  4e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.8 
 
 
557 aa  236  7e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  31.69 
 
 
541 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1636  methyl-accepting chemotaxis protein  39.89 
 
 
547 aa  226  6e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43710  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  31.26 
 
 
541 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3666  chemotaxis transducer  31.06 
 
 
541 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.260935  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.31 
 
 
539 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.910778 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.06 
 
 
619 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.24 
 
 
539 aa  220  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4706  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  31.12 
 
 
541 aa  217  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.61 
 
 
525 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.284544  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  30.36 
 
 
541 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2907  chemotaxis sensory transducer  29.06 
 
 
541 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.7 
 
 
541 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.476721 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0350  toxin co-regulated pilus biosynthesis protein I  37.43 
 
 
620 aa  213  5.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48030  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  29.89 
 
 
541 aa  213  9e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.478475 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.31 
 
 
541 aa  213  9e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.722367  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0897  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.7 
 
 
541 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.31 
 
 
541 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  decreased coverage  0.0000342214 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.34 
 
 
541 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4141  chemotaxis transducer  30.83 
 
 
541 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2268  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.99 
 
 
541 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255239  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4833  chemotaxis sensory transducer  28.89 
 
 
541 aa  210  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000956827  normal  0.082646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3441  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.52 
 
 
541 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0340  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.31 
 
 
541 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.582352  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3114  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  29.81 
 
 
541 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.860602  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.5 
 
 
541 aa  206  9e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.452969  normal  0.355365 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3236  methyl-accepting chemotaxis protein  29.98 
 
 
544 aa  206  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.94 
 
 
541 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2054  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.94 
 
 
539 aa  205  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1491  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  30.24 
 
 
539 aa  203  8e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4624  methyl-accepting chemotaxis protein  30.24 
 
 
539 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0106  methyl-accepting chemotaxis protein  29.24 
 
 
546 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.827543  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0771  methyl-accepting chemotaxis protein  36.36 
 
 
661 aa  197  4.0000000000000005e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.23 
 
 
541 aa  197  6e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.69 
 
 
541 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.88 
 
 
638 aa  196  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3279  methyl-accepting chemotaxis protein  28.54 
 
 
541 aa  195  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149652  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  27.52 
 
 
541 aa  193  6e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.53 
 
 
773 aa  193  8e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2634  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  29 
 
 
542 aa  192  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.917034  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.23 
 
 
499 aa  191  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0811848  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0931  methyl-accepting chemotaxis protein  29.87 
 
 
543 aa  190  5.999999999999999e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5092  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  32.81 
 
 
640 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.9 
 
 
543 aa  189  8e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5553  methyl-accepting chemotaxis protein  33.16 
 
 
640 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2111  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.82 
 
 
572 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.138456  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.46 
 
 
572 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.3 
 
 
562 aa  187  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00511002  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3580  methyl-accepting chemotaxis protein  29.09 
 
 
546 aa  187  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.66 
 
 
564 aa  187  6e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.16 
 
 
638 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0210  methyl-accepting chemotaxis protein  29.71 
 
 
543 aa  186  8e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000824359  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5569  methyl-accepting chemotaxis protein  28.65 
 
 
541 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  36.49 
 
 
712 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  34.79 
 
 
712 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0081  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.4 
 
 
544 aa  184  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.76 
 
 
637 aa  184  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4266  chemotaxis sensory transducer  29.39 
 
 
546 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261421  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3351  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  28.73 
 
 
570 aa  183  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540062  normal  0.0241334 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.87 
 
 
638 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.96 
 
 
638 aa  183  7e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  35.28 
 
 
713 aa  183  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  32.89 
 
 
629 aa  183  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.8 
 
 
640 aa  183  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1197  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.57 
 
 
582 aa  182  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.118848  hitchhiker  0.00410847 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.94 
 
 
533 aa  182  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.24 
 
 
640 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0683  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  27.99 
 
 
568 aa  181  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.268569  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.21 
 
 
638 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.09 
 
 
543 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0986947 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.91 
 
 
830 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1418  chemotaxis sensory transducer  29.35 
 
 
541 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.92 
 
 
541 aa  181  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.6 
 
 
550 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.81 
 
 
716 aa  180  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  36.74 
 
 
639 aa  180  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2878  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  28.54 
 
 
542 aa  179  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425048  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3455  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.84 
 
 
543 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0121993  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2315  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.85 
 
 
653 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.967368  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.59 
 
 
543 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.073872  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  37.01 
 
 
647 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5811  putative chemotaxis transducer  36.93 
 
 
647 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1789  chemotaxis sensory transducer  31.29 
 
 
546 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.478165  decreased coverage  0.000703042 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0513  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.13 
 
 
542 aa  179  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003886  methyl-accepting chemotaxis protein  27.99 
 
 
542 aa  179  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0868  methyl-accepting chemotaxis protein  37.31 
 
 
536 aa  179  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000231989  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3382  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.84 
 
 
543 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1353  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.81 
 
 
547 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.769572  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0925  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.87 
 
 
543 aa  178  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>