More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0712 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0712  methyl-accepting chemotaxis citrate transducer  100 
 
 
546 aa  1085    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0265  methyl-accepting chemotaxis protein  64.1 
 
 
561 aa  673    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001231  methyl-accepting chemotaxis protein  64.65 
 
 
542 aa  681    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.554422  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05097  sensor protein TorS  65.38 
 
 
542 aa  698    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0070  methyl-accepting chemotaxis protein  45.92 
 
 
547 aa  438  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.740118  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05136  torS; sensor protein TorS  46.01 
 
 
558 aa  437  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001261  methyl-accepting chemotaxis protein  45.27 
 
 
547 aa  431  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1434  methyl-accepting chemotaxis protein  42.06 
 
 
543 aa  258  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.66 
 
 
543 aa  248  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.75882  hitchhiker  0.00000661881 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0771  methyl-accepting chemotaxis protein  37.82 
 
 
661 aa  240  5e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  41.26 
 
 
712 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  40.97 
 
 
712 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  39.17 
 
 
713 aa  230  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.4 
 
 
637 aa  227  4e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2643  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.99 
 
 
550 aa  226  8e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0855376  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.22 
 
 
636 aa  224  3e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.57 
 
 
541 aa  223  9e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.608007  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.28 
 
 
638 aa  221  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.04 
 
 
543 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.82 
 
 
716 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0580  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.2 
 
 
679 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4541  methyl-accepting chemotaxis protein  40.24 
 
 
541 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.726322  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3114  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.55 
 
 
541 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.860602  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.3 
 
 
541 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  decreased coverage  0.0000342214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.3 
 
 
541 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.722367  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.7 
 
 
637 aa  217  4e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.19 
 
 
640 aa  217  5e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  39.27 
 
 
541 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.67 
 
 
541 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.476721 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4833  chemotaxis sensory transducer  36.84 
 
 
541 aa  216  9e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000956827  normal  0.082646 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0340  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.3 
 
 
541 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.582352  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.7 
 
 
544 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4218  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.07 
 
 
541 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2907  chemotaxis sensory transducer  40.31 
 
 
541 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  39.43 
 
 
541 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.83 
 
 
541 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.452969  normal  0.355365 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3441  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.22 
 
 
541 aa  213  7e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0897  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.22 
 
 
541 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2634  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.59 
 
 
542 aa  213  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.917034  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  35.02 
 
 
633 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.85 
 
 
541 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.5 
 
 
425 aa  211  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.817651  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  35.91 
 
 
642 aa  210  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0170  methyl-accepting chemotaxis protein  39.61 
 
 
543 aa  210  7e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.07 
 
 
632 aa  209  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.4 
 
 
619 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.15 
 
 
773 aa  208  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1491  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  40.6 
 
 
539 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3279  methyl-accepting chemotaxis protein  36.29 
 
 
541 aa  208  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149652  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4624  methyl-accepting chemotaxis protein  40.6 
 
 
539 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2773  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.57 
 
 
540 aa  207  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2109  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  42.18 
 
 
539 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950044  normal  0.0787865 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.67 
 
 
642 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.44 
 
 
544 aa  207  6e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0868  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.02 
 
 
546 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.61 
 
 
681 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4706  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.82 
 
 
541 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4266  chemotaxis sensory transducer  36.53 
 
 
546 aa  205  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261421  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.98 
 
 
541 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799555  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.62 
 
 
541 aa  204  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.59 
 
 
552 aa  203  6e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14959  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.77 
 
 
552 aa  203  8e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.42 
 
 
558 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3680  methyl-accepting chemotaxis protein  37.5 
 
 
676 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.83 
 
 
638 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.57 
 
 
674 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4528  methyl-accepting chemotaxis protein  36.39 
 
 
672 aa  202  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1418  chemotaxis sensory transducer  40 
 
 
541 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.25 
 
 
634 aa  201  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  39.89 
 
 
630 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3351  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.8 
 
 
570 aa  200  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540062  normal  0.0241334 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  37.93 
 
 
634 aa  200  6e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3580  methyl-accepting chemotaxis protein  35.8 
 
 
546 aa  200  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5569  methyl-accepting chemotaxis protein  39.04 
 
 
541 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.69 
 
 
541 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1334  methyl-accepting chemotaxis protein  36.19 
 
 
550 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  39.94 
 
 
541 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.62 
 
 
653 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297466 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3256  methyl-accepting chemotaxis protein  36.89 
 
 
558 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.6 
 
 
650 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.17 
 
 
739 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247309  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39 
 
 
533 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  37.85 
 
 
647 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  35.99 
 
 
629 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.2 
 
 
572 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.25 
 
 
639 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1636  methyl-accepting chemotaxis protein  38.15 
 
 
547 aa  197  4.0000000000000005e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.35 
 
 
547 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2546  putative chemotaxis transducer  38.44 
 
 
714 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.75 
 
 
647 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5811  putative chemotaxis transducer  38.98 
 
 
647 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0444  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.7 
 
 
647 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414929  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3770  aerotaxis receptor Aer  39.3 
 
 
521 aa  196  9e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.82 
 
 
688 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0900  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.89 
 
 
573 aa  195  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.476047  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.72 
 
 
634 aa  195  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29760  putative chemotaxis transducer  38.44 
 
 
714 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0712  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.76 
 
 
624 aa  196  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.95 
 
 
638 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44300  aerotaxis receptor Aer  37.33 
 
 
521 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>