106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2448 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2448  glycoside hydrolase clan GH-D  100 
 
 
530 aa  1073    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  33.87 
 
 
684 aa  233  8.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.255741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  32.77 
 
 
683 aa  219  7e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3567  glycoside hydrolase clan GH-D  30.13 
 
 
675 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  0.341251 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1360  glycoside hydrolase, clan GH-D  29.69 
 
 
674 aa  207  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  30.97 
 
 
657 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  34.42 
 
 
701 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0130  glycoside hydrolase clan GH-D  30.81 
 
 
669 aa  183  8.000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0394459  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  30.08 
 
 
699 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  26.31 
 
 
713 aa  174  3.9999999999999995e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2515  glycoside hydrolase clan GH-D  31.93 
 
 
679 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  26.97 
 
 
733 aa  168  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0072  glycoside hydrolase clan GH-D  25.21 
 
 
739 aa  167  4e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.723397  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  28.54 
 
 
818 aa  162  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  31.88 
 
 
713 aa  159  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1771  glycoside hydrolase clan GH-D  32.5 
 
 
747 aa  155  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.145856  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0855  glycoside hydrolase clan GH-D  29.95 
 
 
716 aa  154  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.705806  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1776  glycoside hydrolase clan GH-D  36.94 
 
 
718 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191926  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  27.97 
 
 
743 aa  152  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  25.95 
 
 
729 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  36.3 
 
 
723 aa  151  4e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  33.25 
 
 
727 aa  147  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  28.44 
 
 
708 aa  145  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  28.44 
 
 
708 aa  145  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  28.44 
 
 
708 aa  145  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  24.5 
 
 
726 aa  145  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  29.12 
 
 
734 aa  143  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2118  glycoside hydrolase clan GH-D  34.87 
 
 
721 aa  143  7e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1453  alpha-galactosidase  30.4 
 
 
774 aa  142  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1749  glycoside hydrolase clan GH-D  34.19 
 
 
724 aa  142  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205426 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  24.7 
 
 
729 aa  140  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4910  glycoside hydrolase clan GH-D  38.12 
 
 
715 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0910  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.22 
 
 
729 aa  139  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000647683  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2816  glycoside hydrolase clan GH-D  35.08 
 
 
726 aa  139  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.964152 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  28.19 
 
 
718 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2011  glycoside hydrolase clan GH-D  31.77 
 
 
722 aa  137  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  29.77 
 
 
701 aa  137  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31550  alpha-galactosidase  39.56 
 
 
704 aa  137  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135548  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1181  alpha-galactosidase  30.94 
 
 
723 aa  136  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207632  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  33.33 
 
 
699 aa  136  9e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2815  alpha-galactosidase  30.94 
 
 
736 aa  136  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0237  glycoside hydrolase clan GH-D  24.56 
 
 
722 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1781  Alpha-galactosidase  24.94 
 
 
729 aa  134  3e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.725513  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3056  glycoside hydrolase clan GH-D  24.04 
 
 
729 aa  135  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  31.23 
 
 
733 aa  134  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3486  glycoside hydrolase, clan GH-D  36.72 
 
 
688 aa  134  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  31.68 
 
 
728 aa  134  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3471  glycoside hydrolase clan GH-D  32.24 
 
 
733 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  28.5 
 
 
714 aa  131  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6181  glycoside hydrolase clan GH-D  32.49 
 
 
707 aa  131  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.935371  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0475  alpha-galactosidase  24.94 
 
 
730 aa  131  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4077  glycoside hydrolase, clan GH-D  29.92 
 
 
707 aa  130  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.360129  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  29.05 
 
 
714 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  32.07 
 
 
768 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  30.71 
 
 
709 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3388  glycoside hydrolase, clan GH-D  35.06 
 
 
735 aa  129  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1907  glycoside hydrolase clan GH-D  26.6 
 
 
730 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.506598  normal  0.205368 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09035  Putative alpha-galactosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARP5]  28.94 
 
 
726 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1094  glycoside hydrolase clan GH-D  34.31 
 
 
730 aa  127  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3380  alpha-galactosidase  28.79 
 
 
708 aa  127  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3114  alpha-galactosidase  28.79 
 
 
708 aa  127  7e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.024409 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4826  glycoside hydrolase clan GH-D  36.17 
 
 
724 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1706  glycoside hydrolase clan GH-D  26.39 
 
 
727 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.499482  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  29.92 
 
 
709 aa  125  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0491  alpha-galactosidase  24.71 
 
 
734 aa  124  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2479  glycoside hydrolase clan GH-D  30.4 
 
 
740 aa  123  6e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0882  Alpha-galactosidase  24.66 
 
 
740 aa  122  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.24278  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07480  alpha-galactosidase  34.67 
 
 
747 aa  121  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08392  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  28.72 
 
 
732 aa  119  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010447  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5645  glycoside hydrolase clan GH-D  23.83 
 
 
726 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08138  AGLC_ASPNG Alpha-galactosidase C (Melibiase)Alpha-galactosidase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU92]  31.9 
 
 
750 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.261984 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3835  glycoside hydrolase, clan GH-D  28.75 
 
 
719 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.377563  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2915  glycoside hydrolase clan GH-D  29.22 
 
 
706 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2014  glycoside hydrolase, clan GH-D  31.62 
 
 
700 aa  111  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2514  glycoside hydrolase clan GH-D  25.97 
 
 
723 aa  95.9  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  20 
 
 
700 aa  77.8  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  28.64 
 
 
484 aa  70.1  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  27.67 
 
 
824 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0417  glycoside hydrolase clan GH-D  28.95 
 
 
562 aa  60.1  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4312  hypothetical protein  21.99 
 
 
1413 aa  60.1  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319357  normal  0.568612 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01858  alpha-1,6-galactosidase  25.16 
 
 
579 aa  57.4  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  26.82 
 
 
578 aa  56.6  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1626  alpha-galactosidase-like protein  27.44 
 
 
552 aa  56.2  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01910  alpha-galactosidase  27.91 
 
 
505 aa  56.2  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1560  Alpha-galactosidase-like protein  28.48 
 
 
552 aa  55.8  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.59787  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0315  glycoside hydrolase clan GH-D  25.57 
 
 
694 aa  55.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.648797  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2869  Alpha-galactosidase-like protein  27.68 
 
 
679 aa  55.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2828  glycoside hydrolase, clan GH-D  28.49 
 
 
510 aa  55.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.816401  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003824  alpha-1,6-galactosidase putative  24.53 
 
 
579 aa  55.1  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.367398  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  31.53 
 
 
597 aa  54.3  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06470  alpha-galactosidase  26.79 
 
 
589 aa  53.5  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50372  predicted protein  28.57 
 
 
1020 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6587  hypothetical protein  23.08 
 
 
579 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0664  glycoside hydrolase, clan GH-D  23.66 
 
 
684 aa  50.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250528  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  33.67 
 
 
568 aa  48.9  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  30.17 
 
 
548 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0843  glycosy hydrolase family protein  24.68 
 
 
502 aa  48.5  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00330381  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  31.07 
 
 
407 aa  48.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2753  hypothetical protein  29.35 
 
 
1597 aa  47  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264647 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  28.89 
 
 
604 aa  46.6  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>