More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0744 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0744  tRNA pseudouridine synthase A  100 
 
 
240 aa  484  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1452  tRNA pseudouridine synthase A  36.11 
 
 
256 aa  142  4e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000896278  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2995  tRNA pseudouridine synthase ACD  37.3 
 
 
278 aa  131  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2487  tRNA pseudouridine synthase A  37.55 
 
 
252 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3350  tRNA pseudouridine synthase A  35.6 
 
 
247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0985621 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0143  tRNA pseudouridine synthase A  35.1 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000160558  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0626  tRNA pseudouridine synthase A  34.14 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.133889  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2111  tRNA pseudouridine synthase A  36.9 
 
 
254 aa  125  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.110217 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0911  tRNA pseudouridine synthase A  35.2 
 
 
250 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000123783  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0481  tRNA pseudouridine synthase A  37.2 
 
 
246 aa  124  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000089193  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_446  pseudouridylate synthase  36.8 
 
 
246 aa  124  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000332106  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  37.14 
 
 
259 aa  124  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3997  tRNA pseudouridine synthase ACD  35.94 
 
 
270 aa  123  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.541279  hitchhiker  0.00061511 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1901  tRNA pseudouridine synthase A  34.82 
 
 
252 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.48254e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  34.41 
 
 
244 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2939  tRNA pseudouridine synthase A  35.89 
 
 
244 aa  123  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4942  tRNA pseudouridine synthase ACD  35.06 
 
 
272 aa  122  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1156  tRNA pseudouridine synthase ACD  35.55 
 
 
270 aa  122  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133341  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04290  pseudouridylate synthase I  35.71 
 
 
300 aa  121  8e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.477492  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0163  tRNA pseudouridine synthase A  33.47 
 
 
252 aa  121  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000189836  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23260  pseudouridylate synthase I  36.28 
 
 
346 aa  120  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5163  tRNA pseudouridine synthase A  34.26 
 
 
252 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176686  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0937  tRNA pseudouridine synthase ACD  35.77 
 
 
244 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0255  tRNA pseudouridine synthase A  33.47 
 
 
247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000251416  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0321  tRNA pseudouridine synthase A  33.98 
 
 
264 aa  119  6e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000566898  hitchhiker  1.98611e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0137  tRNA pseudouridine synthase A  33.47 
 
 
252 aa  118  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239358  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1219  tRNA pseudouridine synthase A  37.45 
 
 
300 aa  118  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_002936  DET0504  tRNA pseudouridine synthase A  35.34 
 
 
248 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00170943  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0409  tRNA pseudouridine synthase A  34.01 
 
 
245 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.816199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0543  tRNA pseudouridine synthase A  31.85 
 
 
245 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0543  tRNA pseudouridine synthase A  31.85 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.432297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0142  tRNA pseudouridine synthase A  33.47 
 
 
247 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000419417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0137  tRNA pseudouridine synthase A  33.47 
 
 
247 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0135  tRNA pseudouridine synthase A  33.47 
 
 
247 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000154872  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0401  tRNA pseudouridine synthase A  31.85 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1265  tRNA pseudouridine synthase A  33.06 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0142  tRNA pseudouridine synthase A  33.47 
 
 
247 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000771013  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4191  tRNA pseudouridine synthase A  33.06 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1266  tRNA pseudouridine synthase A  33.06 
 
 
262 aa  116  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1174  tRNA pseudouridine synthase A  37.97 
 
 
305 aa  116  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.329599  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0381  tRNA pseudouridine synthase A  34.43 
 
 
264 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1013  tRNA pseudouridine synthase A  36.14 
 
 
245 aa  116  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00481076  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1859  tRNA pseudouridine synthase ACD  32.63 
 
 
245 aa  116  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0155  tRNA pseudouridine synthase A  33.47 
 
 
252 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18067e-36 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0462  tRNA pseudouridine synthase A  31.85 
 
 
245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0487  tRNA pseudouridine synthase A  31.85 
 
 
245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3634  tRNA pseudouridine synthase A  34.71 
 
 
245 aa  115  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0473  tRNA pseudouridine synthase A  31.85 
 
 
245 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0100  tRNA pseudouridine synthase A  34.39 
 
 
258 aa  115  6e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4830  tRNA pseudouridine synthase A  31.85 
 
 
245 aa  115  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0152439  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0492  tRNA pseudouridine synthase A  31.85 
 
 
245 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138657  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0142  tRNA pseudouridine synthase A  32.67 
 
 
247 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629315  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0173  tRNA pseudouridine synthase A  32.67 
 
 
252 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000175513  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2726  tRNA pseudouridine synthase A  33.98 
 
 
259 aa  115  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0139  tRNA pseudouridine synthase A  34.55 
 
 
258 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0466  tRNA pseudouridine synthase A  33.47 
 
 
252 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000184743  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0226  tRNA pseudouridine synthase A  35.97 
 
 
293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3380  tRNA pseudouridine synthase A  35.34 
 
 
273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0405  tRNA pseudouridine synthase A  31.45 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00300726  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5141  tRNA pseudouridine synthase A  33.74 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11531  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0223  tRNA pseudouridine synthase A  35.97 
 
 
293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00472694  normal  0.027676 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0410  tRNA pseudouridine synthase A  33.33 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1248  tRNA pseudouridine synthase A  31.08 
 
 
248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0421  tRNA pseudouridine synthase A  31.45 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417493  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1523  tRNA pseudouridine synthase A  34.01 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000575068  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3729  tRNA pseudouridine synthase A  35.92 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2616  tRNA pseudouridine synthase A  36.96 
 
 
296 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0793  tRNA pseudouridine synthase A  33.87 
 
 
245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000229391  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0612  tRNA pseudouridine synthase A  35.83 
 
 
274 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0407  tRNA pseudouridine synthase A  31.45 
 
 
245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2877  tRNA pseudouridine synthase A  31.73 
 
 
244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00616108  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1544  tRNA pseudouridine synthase A  34.77 
 
 
272 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14908  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2883  tRNA pseudouridine synthase A  30.74 
 
 
270 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101662  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2469  tRNA pseudouridine synthase A  32.11 
 
 
278 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.371859 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1060  tRNA pseudouridine synthase A  30.68 
 
 
248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1318  tRNA pseudouridine synthase A  34.3 
 
 
282 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620089  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4238  tRNA pseudouridine synthase A  31.2 
 
 
250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00146243 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6844  tRNA pseudouridine synthase A  30.74 
 
 
270 aa  112  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000523123  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3871  tRNA pseudouridine synthase A  36.4 
 
 
268 aa  112  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1048  tRNA pseudouridine synthase A  34 
 
 
244 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000774285  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4288  tRNA pseudouridine synthase A  35.32 
 
 
288 aa  111  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.620065  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0717  tRNA pseudouridine synthase A  34.29 
 
 
282 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000371927  normal  0.874871 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1051  tRNA pseudouridine synthase A  33.6 
 
 
255 aa  110  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000873816  hitchhiker  0.00519599 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0136  tRNA pseudouridine synthase A  31.75 
 
 
247 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000296429  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0389  tRNA pseudouridine synthase A  34.11 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0677  tRNA pseudouridine synthase A  31.82 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.873291  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2322  tRNA pseudouridine synthase A  34.38 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1560  tRNA pseudouridine synthase A  33.88 
 
 
302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.949883  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1130  tRNA pseudouridine synthase A  34.51 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.131343 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1258  tRNA pseudouridine synthase A  33.47 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3109  tRNA pseudouridine synthase A  36.19 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1914  tRNA pseudouridine synthase A  34.45 
 
 
351 aa  110  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1237  tRNA pseudouridine synthase ACD  34.57 
 
 
245 aa  109  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0714167  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5154  tRNA pseudouridine synthase A  37.79 
 
 
279 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.195409 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2986  tRNA pseudouridine synthase A  32.11 
 
 
272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0228  tRNA pseudouridine synthase A  33.07 
 
 
255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2410  tRNA pseudouridine synthase A  34.38 
 
 
272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.293969  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4372  tRNA pseudouridine synthase A  31.33 
 
 
267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1652  tRNA pseudouridine synthase A  33.2 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0686  tRNA pseudouridine synthase ACD  36.89 
 
 
246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000903127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>