More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2742 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0158  putative multidrug resistance protein  48.8 
 
 		 1039 aa  938    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0453777  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1320  multidrug resistance protein D  41.11 
 
 		 1024 aa  837    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2742  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1041 aa  2043    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4620  AcrB/AcrD/AcrF family protein  51.45 
 
 		 1052 aa  1056    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0469  acriflavin resistance protein  37.77 
 
 		 1038 aa  796    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03414  hypothetical protein  48.37 
 
 		 1044 aa  938    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2050  acriflavin resistance protein  49.56 
 
 		 1069 aa  1024    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0192  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  34.1 
 
 		 1025 aa  679    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.958952  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0561  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.79 
 
 		 1032 aa  794    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.38553  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0170  acriflavin resistance protein  47.39 
 
 		 1068 aa  941    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644504 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0619  acriflavin resistance protein  49.9 
 
 		 1045 aa  1014    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3332  acriflavin resistance protein  44.93 
 
 		 1057 aa  869    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1679  acriflavin resistance protein  54.88 
 
 		 1048 aa  1077    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.906292  normal  0.699127 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002594  putative multidrug resistance protein  48.18 
 
 		 1034 aa  932    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.018875  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2625  acriflavin resistance protein  43.75 
 
 		 1067 aa  767    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2510  acriflavin resistance protein  54.15 
 
 		 1033 aa  993    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00600549  normal  0.198744 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2569  integral membrane protein, putative multidrug resistance protein  48.4 
 
 		 1042 aa  967    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0974879  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0869  acriflavin resistance protein  48.84 
 
 		 1038 aa  924    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0434774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  36.01 
 
 		 1092 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  35.8 
 
 		 1043 aa  589  1e-167  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5504  acriflavin resistance protein  30.21 
 
 		 1146 aa  463  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3431  acriflavin resistance protein  30.48 
 
 		 1143 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2196  acriflavin resistance protein  46.48 
 
 		 1335 aa  427  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0987  acriflavin resistance protein  43.58 
 
 		 1267 aa  429  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.869665  normal  0.972102 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1162  acriflavin resistance protein  44.4 
 
 		 1189 aa  422  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01960  multidrug resistance protein, putative  28.14 
 
 		 1165 aa  393  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  29.76 
 
 		 1050 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  29.96 
 
 		 1011 aa  389  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  27.79 
 
 		 1044 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  30.3 
 
 		 1033 aa  363  1e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  27.84 
 
 		 1034 aa  354  5e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0507  acriflavin resistance protein  30.69 
 
 		 1020 aa  353  7e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433089  normal  0.988199 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  27.52 
 
 		 1038 aa  346  1e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  27.03 
 
 		 1470 aa  342  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  27.83 
 
 		 1044 aa  340  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  28.65 
 
 		 1043 aa  338  3.9999999999999995e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  26.74 
 
 		 1043 aa  337  9e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  27.24 
 
 		 1496 aa  336  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  26.87 
 
 		 1032 aa  332  2e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  26.9 
 
 		 1039 aa  330  9e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  27.09 
 
 		 1071 aa  330  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  27.43 
 
 		 1041 aa  329  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  25.6 
 
 		 1020 aa  325  3e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  27.67 
 
 		 1101 aa  322  3e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  28.78 
 
 		 1028 aa  320  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.28 
 
 		 1024 aa  319  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  27.54 
 
 		 1034 aa  319  2e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  27.63 
 
 		 1040 aa  318  3e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  25.49 
 
 		 1038 aa  318  4e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  29.76 
 
 		 1017 aa  317  6e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  28.9 
 
 		 1050 aa  317  7e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0879  acriflavin resistance protein  37.05 
 
 		 1290 aa  316  9.999999999999999e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  29.16 
 
 		 1028 aa  316  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  26.86 
 
 		 1046 aa  316  1.9999999999999998e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  27.07 
 
 		 1023 aa  313  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  27.85 
 
 		 1028 aa  313  1e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  27.29 
 
 		 1055 aa  311  5.9999999999999995e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5032  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.33 
 
 		 1024 aa  310  6.999999999999999e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  25.46 
 
 		 1044 aa  309  1.0000000000000001e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  27.49 
 
 		 1036 aa  310  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  27.37 
 
 		 1026 aa  306  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  25.31 
 
 		 1014 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  25.84 
 
 		 1014 aa  304  6.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  25.96 
 
 		 1062 aa  303  1e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  26.26 
 
 		 1058 aa  303  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  26.16 
 
 		 1069 aa  301  4e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  29.18 
 
 		 1027 aa  301  5e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  27.05 
 
 		 1065 aa  300  7e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  30.76 
 
 		 1028 aa  300  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  24.93 
 
 		 1034 aa  298  2e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  28.07 
 
 		 1045 aa  299  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1535  acriflavin resistance protein  29.07 
 
 		 1030 aa  299  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  26.7 
 
 		 1035 aa  298  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.26 
 
 		 1049 aa  297  7e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  28.3 
 
 		 1044 aa  296  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  26.1 
 
 		 1036 aa  296  1e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  28.39 
 
 		 1038 aa  296  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  27.39 
 
 		 1030 aa  296  1e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4170  acriflavin resistance protein  26.39 
 
 		 1171 aa  296  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00460578  normal  0.0104573 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  24.85 
 
 		 1006 aa  296  2e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  25.68 
 
 		 1039 aa  296  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  24.86 
 
 		 1029 aa  295  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  25.74 
 
 		 1053 aa  295  4e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  26.4 
 
 		 1044 aa  293  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4303  acriflavin resistance protein  26.29 
 
 		 1177 aa  293  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763591  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  26.45 
 
 		 1041 aa  293  1e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  28.29 
 
 		 1038 aa  293  1e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  25.66 
 
 		 1047 aa  292  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2399  acriflavin resistance protein  26.41 
 
 		 1032 aa  293  2e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.774253  normal  0.772443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  24.59 
 
 		 1028 aa  292  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  28.12 
 
 		 1043 aa  292  3e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  26.92 
 
 		 1048 aa  291  4e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.5 
 
 		 1024 aa  290  7e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2083  RND superfamily multidrug efflux system protein  26.76 
 
 		 1036 aa  288  4e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.334854  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.95 
 
 		 1067 aa  287  7e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  26.61 
 
 		 1046 aa  287  8e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  32.92 
 
 		 1191 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  28.83 
 
 		 1054 aa  285  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  26.08 
 
 		 1070 aa  285  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  25.96 
 
 		 1086 aa  285  4.0000000000000003e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>