289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2739 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2432  TetR family transcriptional regulator  69.95 
 
 		 239 aa  315  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.625789 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4220  TetR family transcriptional regulator  71.29 
 
 		 239 aa  314  8e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3755  TetR family transcriptional regulator  71.29 
 
 		 239 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3828  TetR family transcriptional regulator  71.29 
 
 		 239 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3767  TetR family transcriptional regulator  71.29 
 
 		 239 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4300  TetR family transcriptional regulator  68.95 
 
 		 236 aa  306  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3278  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 219 aa  181  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2603  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 208 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3791  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353737  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2339  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 208 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2300  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 208 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2347  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 208 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0682211  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5230  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0626  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.852372 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4507  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4594  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60513  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4890  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2355  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8486  putative transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 201 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  0.72211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5079  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1914  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.183306 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0331  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 209 aa  51.6  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1674  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 192 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3071  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0727  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 288 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0320  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 239 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0451  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00762729  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  33.93 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 254 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 200 aa  49.7  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0100  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  26.27 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 222 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  23.72 
 
 		 188 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 219 aa  49.3  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 188 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 228 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  23.72 
 
 		 188 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 233 aa  48.9  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 222 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 206 aa  48.9  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2807  regulatory protein TetR  29.21 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00102447  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 197 aa  48.5  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6467  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 217 aa  48.5  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4816  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 244 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0244477 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  23.32 
 
 		 251 aa  48.5  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  23.72 
 
 		 188 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0500  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3363  regulatory protein TetR  38.24 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.268151  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3447  regulatory protein TetR  32.94 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  25.23 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>